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受到西北大学的邀请,千年基因于11月25日下午在该单位圆满举办基因组学术交流会。千年基因总部Macrogen集团CEO Dr. HyungTae Kim、NGS项目总监Dr. Jinhee Bae、千年基因中国区CEO于越及西北大学的研究人员共同参加了此次学术交流。
本次学术交流中,Dr. Bae向该单位研究人员作了基因组研究的学术报告。针对研究人员重点关注的大片段mate pair文库,Dr. Bae表示在基因组de novo项目中,大片段文库数据可很好地延长Scaffold N50长度,从而显著提高组装结果,并有利于后续生物学意义的深入和准确挖掘。然而,由于大片段文库构建流程的特殊性及其对实验经验的高要求,其构建难度远高于shotgun文库,主要体现在以下几个方面。第一,插入片段越长构建成功率越低;第二,不同物种基因组的重复度高低等指标均会影响大片段文库插入片段长度的目标值;第三,随着插入片段的增大,文库冗余率的升高等均会影响大片段文库最终有效数据的产出。
同时,Dr. Bae也向研究人员介绍了千年基因构建大片段文库的诸多成功案例,并展示了一系列高质量的测序结果。报告结束后,研究人员均对千年基因拥有最高的构建成功率、最准确的文库插入片段大小以及最低的文库冗余率高度认可,并表示今后双方将在大片段文库方面建立更多合作,以发挥其在基因组de novo项目中至关重要的作用。
来源于千年基因官网。
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