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受云南省农业科学院的邀请,千年基因总部Macrogen的生物信息总监ChangHoon Kim博士于11月7日下午在云南省农业科学院作了基因组学术报告,并深入介绍了三代测序在全基因组de novo项目中的应用。该报告受到了云南省农业科学院研究人员的高度认可,最终圆满举办。
随着三代测序技术的发展及其碱基准确度的日益提高,将三代平台与二代平台相结合进行测序也成为目前基因组de novo项目的研究趋势。目前千年基因提供的PacBio RS II三代测序平均读长可达到8-10Kb,最高读长可达40Kb,一致准确性>99.999%。更长读长的数据在跨越重复序列区域、基因重复事件、大的CNV/SV/易位/倒位等结构变异的检出中具有很明显的优势,可显著降低组装后的Contigs及Scaffolds的数量,从而可得到更完善的基因组序列信息及功能基因信息。
在听取ChangHoon Kim博士的报告后,云南省农业科学院的研究人员均对千年基因提供的三代测序非常感兴趣,同时也比较关注如何将三代数据和二代数据有效地利用并进行混合组装。对此,ChangHoon Kim博士向大家分享了千年基因在二代和三代数据混合组装的R&D方面作出的努力和取得的成功,并表示目前千年基因开展的多个大型基因组项目均采用了二代和三代平台相结合的研究思路。
报告结束后,云南省农业科学院的研究人员与ChangHoon Kim博士就前期合作的项目进行了深入的探讨,并表示今后双方将在更多领域开展学术交流和合作!
来源于千年基因官网:千年基因受邀于云南省农科院作基因组学术报告
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