hypermarket的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/hypermarket

博文

1KITE项目中科级分类单元覆盖度的粗略计算

已有 3785 次阅读 2015-6-1 16:28 |系统分类:科研笔记| 昆虫, 鞘翅目, 转录组, 半翅目, 1KITE

       在1000种昆虫转录组计划(1k insect transcriptome evolution, 1Kite)的研究中,主要的类群选取http://www.1kite.org/downloads/1KITE_species.txt)集中在目间关系、多新翅类Polyneoptera、完全变态类Holometabola等几大方向,以及蜻蜓目Odonata、网翅总目Dictyoptera、膜翅目Hymenoptera、毛翅目Trichoptera等类群内部;而在副新翅类中,数据密度相对较低,半翅目尤其如此。从与其它类群的对比中我们可以看出,在昆虫纲最大的几个目中,半翅目和鞘翅目已有数据的覆盖度是最低的,只有1/4左右或更低,低于六足总纲整体上的平均水平。虽然由于分类系统的差异,各目中科的数量会有一定程度的浮动,但是幅度有限,大体格局差不多如表中所示

 

类群名称

1Kite中涉及的科

科的总数

百分比

弹尾目

11

30

37%

原尾目

1

7

14%

双尾目

2

10

20%

石蛃目

2

2

100%

衣鱼目

4

4

100%

蜻蜓目

21

32

66%

蜉蝣目

5

23

22%

襀翅目

12

16

75%

革翅目

9

11

82%

缺翅目

1

1

100%

螳螂目

13

15

87%

蜚蠊目(含等翅类)

12

17

70%

直翅目

20

40

50%

蛩蠊目

1

1

100%

螳䗛目

3

3

100%

纺足目

4

13

31%

䗛目

8

13

62%

啮虫目+虱目

21

66

32%

缨翅目

3

9

33%

半翅目-“Homoptera”

18

85

21%

半翅目-Heteroptera

20

93

22%

膜翅目

63

126

50%

捻翅目

1

10

10%

鞘翅目

44

176

25%

广翅目

2

2

100%

蛇蛉目

2

2

100%

脉翅目

14

16

88%

毛翅目

31

49

63%

鳞翅目

47

95

49%

双翅目

69

159

43%

长翅目

4

9

44%

蚤目

3

18

17%

合计

471

1153

41%

 



https://blog.sciencenet.cn/blog-1292052-894746.html

上一篇:1995-2014的20年间主要序列分子标记在系统发育重建中的使用简况
下一篇:高级阶元昆虫转录组研究中的标本问题
收藏 IP: 60.29.153.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...
扫一扫,分享此博文

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-11-14 09:30

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部