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Nature 509 (2014年5月29日)
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人类基因组草图已经发表十年多了,现在仍然没有与之直接相应的人类蛋白质组草图。但在本期Nature上,两个小组发表了对人体组织、体液和细胞所做的质谱分析,标绘了人类蛋白质组的绝大部分。Akhilesh Pandey及同事识别出17,294个蛋白编码基因,并通过表达分析提供了存在受组织限制和受细胞限制的蛋白的证据。通过从注解的假基因、非编码RNA和未翻译的区域识别翻译的蛋白,他们显示了“蛋白基因组”分析的重要性。他们的数据集可以在www.humanproteomemap.org这个网址获得。Bernhard Kuster及同事为“蛋白质组数据库”(ProteomicsDB,可在https://www.proteomicsdb.org/这个网址获得)中的18,097个基因获得了蛋白证据,展示了这种数据的用途—— 如用于识别数百个翻译的lincRNAs和对药物敏感的标记以及用于发现mRNA和组织中的蛋白水平之间的定量关系等。在本期Nature的其他地方,Vivien Marx报告了第三个大型蛋白质组项目,即基于抗体的“人类蛋白图集”(Human Protein Atlas)项目(http://www.proteinatlas.org/)。封面:Nik Spencer/ Nature。
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