短肠综合征患儿小肠和粪便微生物群的比较

患有短肠综合征的婴儿有影响肠道功能的小肠微生物紊乱。描述小肠微生物群的特征具有挑战性，粪便取样的效用尚不清楚。这项研究比较了粪便样本和小肠中的微生物群。

方法：2016-2017年，从患有短肠综合征和连续性结肠（结肠）或短肠综合征和小肠造口术（SB造口）的婴儿中收集粪便样本。使用16S rRNA测序和qPCR，比较各组和健康对照组之间主要细菌属的丰度和数量。Kruskall-Wallis检验用于分析，P值<0.05被认为是显著的。

结果：从15例小于2岁的短肠综合征婴儿（9例SB造口，6例结肠）和3例健康婴儿中采集样本（n=41）。造口婴儿和结肠婴儿的人口统计学和小肠长度没有差异。短肠综合征组的微生物群与健康对照组有显著差异。粪便样本中含有较多的细菌，但造口组和结肠组在兼性或专性厌氧菌、消炎梭菌、肠杆菌科或双歧杆菌的丰度方面没有显著差异。

结论：短肠综合征患儿的肠道菌群存在紊乱。小肠流出物的取样很有挑战性。粪便样本可能为了解更近端的微生物群落提供了一个窗口。

Piper HG, Coughlin LA, Nguyen V, et al. A comparison of small bowel and fecal microbiota in children with short bowel syndrome. J Pediatr Surg. 2020 May;55(5):878-882.