胃微生物组

发现幽门螺杆菌适应在酸性胃环境中生存推翻了胃是无菌的教条。在H。幽门螺杆菌阴性个体，胃菌群多样性高；大多数显著的胃系统型（链球菌、放线菌、普氏菌、包衣菌）也大量存在于这些个体的口咽部；表明许多成分从更近的部位被吞食，或者口腔微生物群的近亲更远的部位定植。相反，在H。幽门螺杆菌阳性者。幽门螺杆菌通常占胃微生物群序列读数的90%以上，显著降低了该微生物群的整体多样性。幽门螺杆菌占主导地位意味着进化适应了这个特殊的生态位的能力。幽门是典型的两栖动物；幽门螺杆菌为主的胃微生物群与具有重要年龄相关差异的特定疾病密切相关。它的存在增加了患消化性溃疡病、胃粘膜相关淋巴组织（MALT）肿瘤和胃腺癌的风险，但也与反流性食管炎减少和儿童哮喘有关；展示与我们的微生物群的复杂生物相互作用。

人类已经被幽门螺杆菌（helicobacterpylori）定殖至少5万年了，而且很可能是在整个进化过程中。幽门螺杆菌已经适应了人类，在儿童中定居，并在一生中持续存在。大多数菌株具有微妙地调节宿主环境的因子，增加了患消化性溃疡、胃腺癌和其他疾病的风险。幽门螺杆菌基因编码这些和其他因素迅速演变，通过突变和重组，改变细菌与宿主的相互作用。尽管对幽门螺杆菌也有助于致病，人类已经与细菌协同进化，而它最近在许多个体的一生中的缺失导致了人类新的生理变化。这些可能是导致食管腺癌和其他现代疾病增加的原因。

幽门螺杆菌和人类已经共同进化了至少5万年，可能还要更长。因此，H。幽门定植基本上是普遍的，通常的炎症模式可能是泛胃。这种历史上的“正常”联系增加了胃癌的风险，这种疾病自希波克拉底以来就已为人所知。由于胃癌几乎只发生在主要生育年龄之后，因此没有实质性的选择来对抗胃癌；事实上，我们认为癌症可能是有益于前现代社会造成死亡的老年人在一个年龄依赖的方式（1）。相反，消化性溃疡是一种现代疾病，可能是由于我们与幽门相关疾病是古老的还是现代的尚不确定。

人类幽门螺杆菌是新发现的。我们的生理学和免疫学是在持续性胃溃疡的存在下发展起来的。幽门的定植也因此被它的缺失所破坏。在酸稳态的情况下，这种破坏可能导致现代疾病，特别是反流性食管炎和随后的食管腺癌的严重性，其发病率显著增加。我们和其他人假设幽门螺杆菌也可能导致其他现代疾病，包括肥胖和过敏性疾病。从进化的观点来看，幽门可能既没有好处也没有坏处。然而，从21世纪人类健康的角度来看，观点是不同的。如果得到证实，最近的数据暗示了一个早期生命受益于幽门螺杆菌和晚期生命成本。