首批培养的1000种人类胃肠道微生物群

栖息在人类胃肠道的微生物构成了一个复杂的生态系统，其功能对我们的全身代谢有重要贡献，并对健康和疾病产生影响。根据其重要性，人类胃肠道微生物群已被广泛研究。尽管有相当一部分肠道微生物尚未培养，但目前已经鉴定出1000多种不同的微生物种类，它们可以存在于人类胃肠道中。塞尔维亚贝尔格莱德大学技术与冶金学院生物技术与生物化学系的Rajilic-Stojanovic和荷兰瓦格宁根大学微生物实验室de Vos 根据92种真核菌、8种古菌和957种细菌的小亚基核糖体RNA基因序列的系统发育框架，对1057种肠道微生物进行了系统综述和详细的参考文献。此外，它统一了关于这些胃肠道微生物的流行、丰度、稳定性、生理学、遗传学以及与人类健康的关系的知识，这些知识目前分散在过去150年出版的大量文献中。这些详细的生理和遗传信息有望有助于提高我们对胃肠道微生物群的认识。此外，它为未来的比较和功能性宏基因组以及其他需要系统和生理基础才能产生影响的高通量方法开辟了途径。

在一个多世纪的人类胃肠道微生物群研究中产生的知识表明，这个生态系统确实是一个被遗忘的人体器官。关于胃肠道微生物群的大量数据在时间和空间上都是高度分散的——这是本综述旨在纠正的一个警告，试图将所产生的知识系统化。值得特别关注丰富而重要的微生物群的多样性和确定的功能。他们的库存报告了1057种培养的胃肠道物种，而更多的预计仍将培养。虽然胃肠道微生物群的培养是一项艰苦的工作，但对单个胃肠道分离物进行详细的生理生化鉴定是这一研究领域取得进展的必要步骤。这一点已被越来越多地认识到，最近的高通量培养研究证明，培养可以作为发现目前未知胃肠道共生微生物的有力方法。剩余的大多数胃肠道微生物群的未来培养有望提高我们对这一生态系统的理解，而这一综述可作为发现前1000种肠道物种时胃肠道微生物群多样性和功能的基线。