人类主要生境细菌群落类群的探讨

确定细菌丰度变异是了解个体间细菌相似性的第一步。根据丰度模式描述微生物分布的后续步骤是将细菌群落划分为不同的类群或群落类别。Zhou等人对人类微生物组学项目中236名健康人群的粪便、鼻腔、皮肤、阴道和口腔环境中的细菌群落进行了分析。他们在前鼻孔、四个皮肤部位和阴道的属水平上确定了不同的群落模式，还确认了三种以前在粪便中发现的肠道类型。在大多数口腔部位发现了两个轮廓值较低的簇，其中细菌群落更为均匀。在一个生境中共享一个群落类的受试者不一定在另一个生境中共享一个群落类，除了在三个阴道部位和左右耳后皱褶的对称生境中。人口统计因素，包括性别、年龄和种族，显著地影响了一些生境中的群落组成。阴道、耳后皱褶和大便的社区分类在大约200天内保持稳定。社区组成、人口统计学因素与社区类别的关联以及社区稳定性的证明加深了我们对人类微生物组的变异性和动态性的理解。这对于寻求微生物与临床表型相关性的实验设计也具有重要意义。