写作排版必备

NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 （原理、代码和评述）)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图、功能富集）等内容。

Markdeep: 文档书写展示两不误

Markdown是一种轻量级标记语言，允许人们使用易读易写的纯文本格式编写文档（别人的电子书，你的电子书，都在bookdown）。手头只要有一个文本编辑器，不管是在笔记本还是在服务器都可以自由写作（Linux - VIM的强大文本处理方法）。而且由于是纯文本文件，可以方便使用Git管理（Windows轻松实现linux shell环境：gitforwindows）。

写作是方便了（英语写作常见错误总结和学习视频），但呈现给别人看时不免就有些麻烦，需要一些支持Markdown的编辑器或转换工具进行转换，重要的是不方便回转。发给别人的Markdown脚步看着不舒服，转换后看着舒服，修改又不方便了。

现在，有了一个工具Markdeep(一段JavaScript代码，起始写于2015年，一直维护升级至今)，使得我们只要在写作的Markdown文档中引用下这段代码（就是简单的在文件末尾加一句话）就可以轻松实现Markdown和网页的互转。

其支持的特性也比较多，常见的Markdown标题等级、代码高亮、引用、列表、表格等，还支持一些新的功能，简单列举几个：

1. 直接嵌入多种形式的流程图，如ASCII流程图 （中文支持不好）和gravizo流程图，支持。

2. 支持自动生成目录（层级少时不生成目录，层级多时生成目录）。

3. 支持嵌入Base64格式的图形，解决Markdown图形引用的问题。

4. 支持引用其它Markdown文件，方便大文件拆分成多个写作。

5. （3）和（4）结合起来可以很好的处理图形引用问题，每个图形的Base64单独放一个文件，在主文档引用展示。

6. 支持嵌入Latex公式（万能转换：R图和统计表转成发表级的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量图等）。

7. 支持嵌入视频。

8. Markdown格式和HTML格式轻松转换。

9. 也可以很方便的导出成PDF。

更多功能按需获取，具体使用请看公众号里的视频。