SBS：边合成边测序反应，每次SBS会延伸一个碱基，大约耗时70分钟。
Run：单次上机测序反应，可以产生4G-75G测序通量不等。
Lane：单泳道，每条泳道可以直接物理区分测序样品，1次run最多可以同时上样8条Lane。
Channel：Lane的同义词。
Tile：小区，每条Lane中排有2列tile，合计120个小区。每个小区上分布数目繁多的簇结合位点。
Cluster：簇，在Solexa测序技术中会采用桥式PCR方式生产DNA簇，每个DNA簇才能产生亮度达到CCD可以分辨的荧光点。
Index：标签，在Solexa多重测序（Multiplexed Sequencing）过程中会使用Index来区分样品，并在常规测序完成后，针对Index部分额外进行7个循环的测序，通过Index的识别，可以在1条Lane中区分12种不同的样品。
Barcode: Index同义词

Hiseq 2000 与 2500比较：

2000的通量600G/RUN,2500的通量120G/RUN
2000有2个flowcell,每个flowcell8个lane
2500的也是2个flowcell，快速模式中每个flowcell2个lane，每个lane产出30G数据量