脂溶性是药物化学中小分子的重要参数,  通常用 log P 与 log D 进行表示. log P 为化合物油水分配系数 P 的对数值,  指未解离的分子在油相与水相的分配平衡.  logP 值与化合物的水溶性、透膜性、体内 ADME  过程以及化合物与受体的亲和力均存在密切的关系,  在化合物透过生物膜的过程中具有关键作用.  而当考虑到不同 pH 条件下化合物的存在状态不同,  引入了 log D 来描述所有存在形式的化合物(离子与分子形式）在油相与水相的分配平衡. 口服药物通过被动扩散渗透时，logP 0-3范围是最佳，高logP化合物水溶性差，低logP化合物脂渗透性差。

Hughes reported that highly lipophilic compounds clogp > 3 with low polar surface area (TPSA < 75 À2 在临床前的不良反应研究中存在6倍的风险。高的亲脂性导致高的肝清除率。 lipophilic efficiency （LipE） 亲脂性效率指数 参数大于5认为比较合适。

绝对多少的药物都含有离子化基团，大部分呈碱性，药物工作者可以通过修饰药物分子中的酸碱基团来获得理想的pKa，从而影响药物的溶解性与渗透性，pH=pKa时，离子组分与中性分子浓度相等。对于酸性化合物：

溶液PH下降，药物中性分子浓度升高，离子组分浓度减小。

对于碱性化合物：

溶液PH下降，药物中性分子浓度减小，离子组分浓度增大

离子化的组分溶解性好，但渗透性差，高渗透性的化合物通常溶解性低。碱性化合物比酸性化合物更易于透过血脑屏障。