生物信息学 之 计算表观遗传学分享 http://blog.sciencenet.cn/u/hongbo919 森罗万象是表观, 追根溯源系遗传。 计算精研千淘漉, 天道酬勤志更坚。

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分享 [转载]SAMtool bitwise flag meaning explained
2018-9-30 23:28
If you got samflags and want to know their meaning quickly thenyou can check their meaning interactively following this link. You type in a flag and will get the answer at Piacrd official site. You can also look up the meaning of samflags in a pdf file sam_output in pdf . Or ...
个人分类: 科研经验|619 次阅读|没有评论
分享 Install python package without root (pip安装到指定目录)
2018-9-30 23:26
_______________ 方法1 (亲测有效)_______________ pipinstall--userpackage _______________ 方法2 _______________ pipinstall--install-option=--prefix=$HOME/localpackage _______________ 方法3 _______________ 用户 ...
个人分类: 科研经验|1260 次阅读|没有评论
分享 快速绘制染色体区域信息
2018-9-30 23:26
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/tools/gdp/
个人分类: 科研经验|1121 次阅读|没有评论
分享 [转载]Can we use shell variables in awk? (转)
2018-9-30 23:25
There are a bunch of ways of doing it, but my favorite is to define a variable with thede -vdeflag: de$echo|awk-vmy_var=4'{printMyvarismy_var}'Myvaris4de Just pass ...
个人分类: 科研经验|346 次阅读|没有评论
分享 PHP7 升级后Mysql报错的解决方案
2018-9-30 23:24
近期GoDaddy莫名其妙的自动升级了PHP版本(5.*7.*),导致Mysql数据库无法连接,这一错误的根源在于原有网页采用了mysql_connect,而PHP7将不再支持该模块,因此需要将网页中的mysql_connect更新为MySQLi或者PDO_MySQL,详情参考:http://php.net/manual/en/function.mysql-connect.php 解决办法:将原代码中 ...
个人分类: 科研经验|473 次阅读|没有评论
分享 [转载]How to fix this error [SSL: TLSV1_ALERT_PROTOCOL_VERSION]
2018-9-30 23:23
I am trying to install python library using de pip de, getting ssl error. 1 2 3 4 5 6 de ~dede /projects/basedede ? pre-master± pipdede installdede xdictde de Collecting xdictde de Could not fetch URL htt ...
个人分类: 科研经验|798 次阅读|没有评论
分享 安装 R-3.5.0
2018-9-30 23:22
Error: checkingforzlib.h...yes checkingifzlibversion=1.2.5...no checkingwhetherzlibsupportsuffices...configure:error:zliblibraryandheadersarerequired Try: h ...
个人分类: 科研经验|930 次阅读|没有评论
分享 从一则招聘启事看生物信息研究者应掌握的十种能力
2018-9-30 23:21
Introduction (招聘原文): Several full-time postdoctoral positions are immediately available for Ph.D. graduates with experience in Bioinformatics (computational genomics) at the Bioinformatics Core, Cancer Science Institute of Singapore. The focus of the core is on understanding computa ...
个人分类: 科研经验|589 次阅读|没有评论
分享 Linux实用命令
2018-9-30 23:17
1、查看系统访问日志(实时) tail --lines=100 -f /var/log/secure 2、按列合并文件 pastefile1file2 combind.txt 3、按行合并文件 cat file1file2 combind.txt 4、 Linux:使用awk命令获取文本的某一行,某一列 1)、打印文件的第一列(域) ...
个人分类: 科研经验|519 次阅读|没有评论
分享 PHP7升级后Mysql报错的解决方案
2018-1-8 06:44
近期GoDaddy莫名其妙的自动升级了PHP版本(5.*7.*),导致Mysql数据库无法连接,这一错误的根源在于原有网页采用了mysql_connect,而PHP7将不再支持该模块,因此需要将网页中的mysql_connect更新为MySQLi或者PDO_MySQL,详情参考:http://php.net/manual/en/function.mysql-connect.php 解决办法:将原代码中的m ...
个人分类: 科研经验|5454 次阅读|没有评论

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