博文
- SPIM显微镜
- 对SPIM感兴趣的朋友，这里有一个很好的网站，里面介绍了一些搭建经验和技巧，如果有光学背景应该可以follow.对生物背景的人，这也是个很好的学习和问题的平台。 http://openspim.org/Table_of_parts
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波谱学基础
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- 最近正组织一些人出版一部单分子生物物理专著，下面是第二章关于波谱学的一节。有感兴趣的朋友欢迎加入我们参与写作。 波谱最早指可见光通过棱角时不同波长光的发散，然而现 代 的波谱学概念早已得到了极大的延伸。波谱学主要研究具有特定波长或频率的电磁波与物质的相互作用，波谱学数据就是吸收或 ...
- 电子倍增式CCD
- 最后简单介绍一下单分子实验中常用的信号采集装置。请读者先行了解 CCD （电荷耦合器件）的工作原理。 EMCCD （ Electron-multiplying Charge-coupled Device ，电子倍增电荷耦合组件）是特别适用于低光强条件下的设备。和普通 CCD 一样，入射光子在每个像素内转化为电子，电子再被依次平移到读取设备上 ...
- 固定细胞的免疫染色
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- 固定细胞的免疫染色 总体来说，对 (d)STORM 而言，固定细胞的免疫染色法和普通的免疫荧光实验相同。其主要区别有： 1. 如果是使用 TIRF 模式成像，要将细胞置于匹配的载玻片上。 2. 染色结束后，一般不将样品置于封片剂（ mounting medium ）中，而在 PBS 缓冲液中保存。 3. 基于第二点，为避免 ...
- 荧光标记的选择和组合
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- (d)STORM 和 PALM 的选择，与细胞学实验中选择免疫荧光染色或是遗传学标记的很多考虑是一样的。 (d)STORM 可以用抗体识别内源性的蛋白，但识别的特异性受到抗体质量的影响（例如对于有些蛋白质，并没有特异性高的抗体）。而 PALM 需要对目标蛋白基因进行序列修饰，加入光控蛋白的片段，再转染目标细胞。在目标蛋白 ...
- STORM数据处理中漂移补偿
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- 实验中的漂移基本上无法避免的。事先预热仪器（特别是样品平台和压电平台），可以减少实验中的样品漂移。在 (d)STORM 实验中，如果使用非常高的激发光强，加快荧光分子进入稳暗态的速度，配以很高的采集速度（ 100Hz 以上），可以将单张图片的采集时间压缩在数分钟之内，这样实验期间的漂移就减少到无需补偿的程度。莱 ...
- 远红外显微镜
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- 苏州大猫最近申请的专利项目，如果有需要的朋友欢迎垂询。 用加热的方式控制外源基因表达和离子通道开关，在生物医学中有着非常广泛的应用。热激蛋白启动子是一组在结构上高度保守的多肽，当外部温度较高（大于 35 度）时，该启动子被激活并调控其下流基因的表达。该方法是发育生物学中 ...
- 平面光显微镜(selective plane illumination microscopy, SPIM)
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- 平面光显微镜是我们目前工作的重点，目前我们基本已经完成prototype样机的组装和调试。平面显微镜的思想成熟于1903年，但平面光显微镜技术直到2004年才真正在实验室中实现。他们的优势是快速低损伤的三维成像，每秒中可以采集一个三维图像，每毫秒可以采集一个2维图像。快速成像是追踪快速变化的细胞和发育过程 ...
- 单分子拉曼新进展
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- 今天读到一则新闻：单分子拉曼光谱成像做到0.5nm了，很难预料单分子技术的极限在哪里，很多看似不可能的事情正在变得可能。在FIONA基础上发展的STORM和PLAM的水平分辩率已经可以达到20nm,20nm就是一些大分子如核糖体的尺寸，如果STORM能具有SPIM的成像速度细胞生物学又会迎来一个发展的黄金期。我们正在全力 ...
- 参加儿童夏令营的感想
- 今日参加儿子的童子军夏令营，亲身感受了美国教育的不同，虽然我参加的只是整个活动的一部分，但还是对此深有感悟。主持人请了几个天文学出身的学者和美国航天部的工作人员来给一群4-10岁的孩子津津讲授航天知识和太空的星际常识。而中国的孩子每天面对的就是题海战术，农村的孩子更惨，父母没有教育家庭条 ...
