xinhuotiantang的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/xinhuotiantang

博文

为什么生物研究最好可视化 精选

已有 6529 次阅读 2017-12-12 23:15 |系统分类:科研笔记| 晶体, 可视化, 生物研究, 蛋白结构预测


有句话叫做“看得见摸得着”,在生物研究中最好还是如此。直观的向人们展示你的研究成果,不空洞,有根据,有依据,通俗易懂。研究中得出的结论在历史的面前都是浅显的,能让人明白。

记得电影里中会有这样的情节,研究人员在开始做实验之前不是去准备实验,而是点开摄像机的按钮,记录下每一次的时间流程,一方面作为实验的记录有可能提高实验的重复性,另一方面便是证据(为什么需要证据,科学研究是严谨的不是想象的),当然其中的好处自己可以体会。现在的研究可视化,可以有各种的表现形式,总的来说只要是可靠安全严肃的结果都是可行的。图标,图表,线条,影像,图片等等都体现在其中。

实验数据的分析,可以使用图片来记录,各种基因关系的预测可以使用图表来说明,举个例子,像这样的网状图给人以一种直观的形象。在这里有一点是需要说明的,结果的可视化就像是人的骨骼一样,文字的描述就是血肉,骨骼和血肉是缺一不可的,尤其是某些复杂研究结果的阐述显得尤为突出。

想到这里我更是回想起生物课本上有关于物种进化关系的图谱,形象而生动的表现出物种进化的对应关系,这种关系的可视化是基于长时间的研究总结出来的,有着其自己的合理性,现代研究过程中有许多的进化关系可以通过给位大神的研究加以总结,推断,预测出来的,举个例子。

在蛋白质的空间结构上又有很大的作为,现在有太多的网站可以制作或者预测蛋白质的空间结构,这些便利给人们省去了很多的精力和时间(重要的还是时间),空间立体结构,受体靶点,药物可能作用位点,可修饰作用位点,结构的稳定性等等,无一在可视化中展现出来。想到这里我想起了晶体(纯粹知识想起),学生每每的养出一个好看的晶体就高兴地紧张起来,哈哈,我也高兴的有点乐,大自然的美是神奇的,各种晶体结构有着自己的规则与体现,当然一些晶体的体现,也反过来印证软件预测的准确性。

文章的发表通俗一点就是发表paper,落实到杂志文本上,可是有一种视频的发表也叫作paper,是以另外一种形式阐述结果,倾注着科研人员的大量心血。现在网络技术的发达,有很多的这样的网站比如:https://www.jove.com/,有时候看大家视频,能给自己一些灵感,有兴趣可以试一下。

夜深了,乏了。

在这里再次重申,生物研究的可视化并不脱离文字性描述,他们是相辅相成的,只是能够将结果更好的表现出来的一种方式。能够正确合理的展现研究结果,其实哪种方式都是可行的。



http://blog.sciencenet.cn/blog-928340-1089391.html

上一篇:世界互联网大会想到些事情?

2 黄永义 shenlu

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (2 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2020-8-14 14:04

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部