如何在没有经费的情况下做科研

热度 3 邵斌 2024-3-19 10:29

近日，我担任第一兼通讯作者的文章在Nature Communications上线（ https://www.nature.com/articles/s41467-024-46241-8 ），这篇工作是笔者在没有科研资助的情况下完成的，在这里分享一些经验和思考。 实验的家伙事 在做这个工作之前，笔者的主业是合成生物学与分子生物学，见我之前的博文《 质粒拷贝数 ...

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机器人会梦见电子羊么--浅谈生命科学中的学科交叉

热度 2 邵斌 2021-12-25 01:18

《机器人会梦见电子羊么》（Do Androids Dream of Electric Sheep）是作家菲利普·迪克出版于1968年的一部科幻小说。它的电影版可能更被人熟知，即《银翼杀手》以及《银翼杀手2049》。在书中随着科技进步，自然人和仿生人（Android）的界限愈发模糊，当仿生人能够无限逼近自然人，究竟会发生什么？这种设定今天看来 ...

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生命是机器么

热度 10 邵斌 2019-7-7 07:04

最近读到一篇不错的文章，题目叫 Is the cell really a machine? ，很有启发性。作者主要探讨了还原论方法解释生命问题的局限性，不过具体该怎么做，还不是很清楚。 下面这张图是 13 年前的图了 ，这张图我在报告里面用过，其类似的版本很多人也用过。 仔细推究的话它其实有很多问题， ...

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人工智能与42：从AlphaFold谈起

热度 5 邵斌 2018-12-6 12:39

最近 deepmind 又出了一个大新闻，名为 AlphaFold 的算法在蛋白质折叠领域大胜传统模型，相关报道可以参考 该链接 。大意是在两年一度的国际蛋白质结构预测竞赛（ CASP ）中， DeepMind 团队新开发的 AlphaFold 模型利用神经生成网络表现惊人，把第二名远远甩在身后，在 43 个参赛蛋白中拿到 25 个 ...

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深度学习与生物医疗

热度 1 邵斌 2018-9-14 11:06

这期《自然·生物技术》中有一篇谈深度学习的文章 ，题目是“Deep learning in biomedicine”，作者是来自多伦多的Brendan J Frey等人。深度学习现在人们谈论的很多，在生物，医疗，甚至物理领域都有不少应用。之前在 biorxiv 上有一篇综述，叫“ Opportunities And Obstacles For Deep Learning In Biology ...

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发表文章需要多久

热度 7 邵斌 2018-8-12 10:29

前段时间看到了一个有趣的博客，有很多数据，在这跟大家分享 。作者是Jean Monlong，现在是加拿大McGill University的一名博士生。他的博客叫海马区（Hippocamplus）。 话不多说，上图。本图是各个杂志接受文章和发表文章所需时间的中位数（按天数计算） 可以看到 Plos One 和 Scientific report 表现 ...

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没有理论的学科会怎么样

热度 20 邵斌 2018-8-1 10:16

这是我最近看到的一个博客 ，作者是阿姆斯特丹大学的心理学家 Denny Borsboom 。我不是心理学家，也不做实验心理学，但我觉得这篇文章的观点很有启发价值，也适用于其他领域，像生命科学。但他提出的对于理论价值，乃至学术风气的一些看法很值得参考和讨论。 科学理论可能是研究工作里最伟大的 ...

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博士后都去哪了

热度 3 邵斌 2018-2-1 11:48

前几天Nature biotechnology发表了一篇有趣的文章，题目是“Visualizing detailed postdoctoralemployment trends using a new career outcome taxonomy”。直白的翻译过来，应该叫博士后都去哪了。我自己身为博士后大军的一员，对这个问题很感兴趣。这也是我看到的第一个针对博士后职业发展的研究，所以在这里大概介绍一 ...

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什么样的结果是显著的：浅谈p值

热度 4 邵斌 2018-1-4 11:00

p 值是现在常用的统计学指标。当我们检验一个统计假设 H 0 时， p 值是当 H0 为真时样本结果或者更极端结果出现的概率。 p 值越小，也就越应该拒绝原假设，也就是结果越显著。在现在的生物医学研究中，一般的显著性标准是 p 值 0.05 。但这个标准最近几年引发了非常多的争议，比如虽然很多癌症研究都声 ...

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