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Medline数据库中相关记录的计算方法【节译】
热度 1 2011-2-15 10:50
我们将寻找相关文献的问题归纳为如下模型:给定某篇用户表示感兴趣的文献,系统的任务就是找到用户也会想要浏览( examine )的文献。因为这种活动往往发生在更为广泛的信息搜寻的行为之中,相关性可以作为感兴趣的指标,即,检索其他相关的文献。但是,我们用更宽泛的术语来描述这个问题:其他文献之所以成为感兴趣的 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|3379 次阅读|1 个评论 热度 1
咔吧咔吧的浪漫
热度 2 2011-2-1 18:55
一首小诗,是我们同学间耳熟能详,提起来就深情款款的。 “我是不会变心的, 就是不会变 大理石雕成塑像 铜铸成钟 而我却是由忠诚制造的 即使破了碎了 也片片都是忠诚” 第一次听到它,是在我们大学的新年联欢会。一位温柔美丽的女老师,向我们这些情窦初开的少男少女讲述了自己的情感经历,最后,含泪把这首诗喃 ...
个人分类: 休闲|2261 次阅读|3 个评论 热度 2
审稿中遇到的形形色色
热度 8 2011-1-24 12:55
给几个信息学及医学信息学专业的杂志审稿,杂志水平参差不齐,稿件呢自然也是有高有低的,但是无论如何,说心里话,这真是个很好的了解和学习本专业甚至相关专业新进展和新名词的机会:很多新词让我硬着头皮去读,然后去找相关的资料,这个期间,我主动或者是被动地学习了很多新知识。 然而有趣的是,在找资料过程中,偶尔 ...
个人分类: 科研体会|4609 次阅读|9 个评论 热度 8
回望2010,一脸茫然
热度 3 2011-1-17 10:08
看了信忠保老师的博文 《我失败的2010年:科研反思》, 深有同感。 一直想总结一下2010,真的是一脸的茫然:记不起来1月份干啥了,二月份有什么事儿,......。我不知道这一年我都干了什么。 最让我纠结的是,有想法,没办法。很多的想法,一直在心里冲动,也有很多的学生,可以和我一起来做这些,可是就是不知道如何 ...
个人分类: 休闲|3484 次阅读|3 个评论 热度 3
为什么Hubs(中心蛋白质)在蛋白质网络中易于成为必要蛋白质
2011-1-10 11:05
概述 网络由多个节点相互连接而成。大多数复杂网络都是无标度网络,这种网络中各个节点所拥有的边数呈幂律分布,就是说,在一个无标度网络中,有一小部分节点有较多的连接,我们称之为 hub (车轮轮辐的中心,或者网络中的集线器,本文中译作中心节点),而大量的节点则有较少的连接,我们称这些节点为非 hub 节 ...
个人分类: 生物信息学|10582 次阅读|1 个评论
蛋白质网络中的中心-致死法则【译文】
2011-1-7 13:40
传统上,人们对蛋白质的分析都是基于单个蛋白质的作用的,如把它当做细胞或者微生物的催化剂、信号分子或者构建模块,然而在当今的后基因组时代,我们对蛋白质的认识扩展到了将其作为蛋白质相互作用网络中的元素,在网络中,蛋白质在功能模块中具有相关的或者分子上的功能。这里,我们显示了酿酒酵母菌单基因缺失的表型后 ...
个人分类: 生物信息学|6156 次阅读|没有评论
新年乐一下
热度 1 2011-1-1 07:36
走在黑咕隆咚的楼梯里,靠跺脚,呼唤感应灯送来光明。不想3楼的缓步台,一对男女学生在相拥相吻,好生尴尬,怕打扰人家,轻轻地绕过去。 当我走到他们身旁时,突然,感应灯都灭了...... ....... ....... ....... ....... 男孩举起环抱在女孩腰上的手,在女孩子的PP上啪地拍了一下, ...
个人分类: 休闲|2715 次阅读|2 个评论 热度 1
CLUTO说明书节译
热度 4 2010-12-24 12:34
一个聚类分析的软件,发现有些文本聚类的论文采用这个软件。 个人感觉它的优点是:1.对行和列同时聚类;2.提供对类别的描述;3.对聚类效果有评价比较的参数,如类内相似度,类间相似度等。 它的图形化版本就是gCLUTO。 概述 聚类算法把 ...
个人分类: 休闲|12616 次阅读|7 个评论 热度 4
看问题的角度很重要
2010-12-14 16:23
鬼使神差地,我做了响当当童鞋的副导师,正导师是社会医学专业的,我指导她使用信息学的方法。这样一来,我们俩成了她正导师的考生:正导师有了问题,她就来问我,问题都是从专业角度提出来的,往往是相当的刁钻古怪,让我疲于应付,经常是让我意乱心烦。许是从她导师那里耳濡目染来的学风,今天问我:得到了高被引期刊, ...
个人分类: 休闲|4105 次阅读|没有评论
词和论文同时聚类告诉我们什么了?
热度 1 2010-11-19 09:55
最初的目的,是想研究一下如何利用主题词关联规则从文章中抽取informative sentence。 首先,选定一个主题阿司匹林引起胃肠道出血,在PubMed中输入了检索词: Aspirin/adverse effects AND Gastrointestinal Hemorrhage/chemically induced 并限定要有文摘的文献记录,得到了1 ...
个人分类: 休闲|5178 次阅读|2 个评论 热度 1

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GMT+8, 2021-6-13 08:31

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