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基于文献的发现实例[译文]
2008-10-14 02:20
Stegmann and Grohmann Stegmann and Grohmann 通过运用共词技术拓展了 SL 方法,这是一种用于聚类的统计学方法。他们不使用单词或者概念,而是分析文献集合中每对 MEDLINE 文献的关键词共同出现次数。关键词包括 MeSH 以及酶标记号和 CAS 注册号。这些分析最后生成了所包含关键词的地图或者战略坐标&rd ...
个人分类: 生物医学文献计量学|3831 次阅读|没有评论
利用本体为基础的文本挖掘方法从MEDLINE文摘中抽取生物学关系抽取并应答查询
2008-10-14 02:14
生物学文本数据存储量的急剧增长使得造成了人类方便有效地获取所需信息上的困难。问题的出现是由于大多数信息都隐含在无结构或者半结构的文本中,这些文本计算机无法轻易地理解。 本文介绍了一个基于本体的生物学信息抽取与查询应答系统( Biological Information Extraction and Query Answering , BIEQA ), ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|4023 次阅读|1 个评论
MetaMap程序是如何把生物医学文本有效地匹配到一体化医学语言系统的超级词表的
2008-10-12 08:35
文摘 :一体化医学语言系统( UMLS )是生物医学领域里面最大的词表,可以用在诸如年决策支持系统、病历管理、信息检索和数据挖掘之中。如何利用 UMLS 成为目前的重要话题。本文介绍了 MetaMap 程序是如何把生物医学的文本与 UMLS 中的超级词表( MetaThesaurus )相匹配,换言之,就是在生物医学 ...
个人分类: 生物医学文本挖掘|11272 次阅读|1 个评论
GEO:基因表达大棚车(Gene Expression Omnibus)
热度 2 2008-10-12 08:27
GEO Database 近年来,利用高通量方法检测基因表达越来越普及,诸如微阵列杂交和基因表系列分析( SAGE )可以同时测量数以万计的基因转录脚本( gene transcript )。基因表达大棚车( GEO : Gene Expression Omnibus )则是归档和自由分发科研人员提交的高通量基因表达数据的公共仓库 ...
个人分类: 生物信息学|27414 次阅读|4 个评论 热度 2
从文本资源中建立医学本体的方法(节译)
2008-9-30 23:15
医学领域里,人们普遍认可应该通过建立本体来开发无歧义的词表。本研究的目标是帮助肺病学专家对其诊断和治疗活动进行编码,用一个采用专业本体表现医学知识的软件。本文介绍了我们根据从文本中抽取术语建立医学本体的知识工程学的方法。将自然语言处理工具应用于病人出 ...
个人分类: 生物信息学|3794 次阅读|没有评论

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