MATLAB优化算法分享 http://blog.sciencenet.cn/u/Jasion Optimization Problem

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置顶 · 分享 LORA_修理级别分析_三层三级民机修理级别经济性分析模型的改进
2019-11-20 22:58
三层三级民机修理级别经济性分析模型的改进 引用格式 : 贾宝惠 邓婉怡 王毅强. 三层三级民机修理级别经济性分析模型的改进 . 航空学报, doi: 10.7527/S1000-6893.2019.23468 . 期刊:航空学报 作者:贾宝惠,邓婉怡,王毅强 单位: ...
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分享 matlab ode 常微分方程组
2018-1-23 21:47
http://cn.mathworks.com/help/matlab/ref/ode45.html %main.m clc clear a=0.034; b=0.005; r=0.274; x0= ; tspan= ; = ode45('fun',tspan,x0); plot(t,x(:,1),'r-o',t,x(:,2),'g-*',t,x(:,3),'b-*',t,x(:,4),'k-*') %fun.m function dx=fun(t,x) a=0.034; b=0 ...
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分享 hisat2
2017-11-28 22:33
hisat2-build -p 15 -f TAIR10.fa --exon TAIR10.exon --ss TAIR10.ss TAIR10 samtools view -bS *ult.sam result.bam samtools sort result.bam -o result.sorted.bam cufflinks -p 20 -u --library-type fr-firststrand -g /home/wuz/input/hiTAIR10/TAIR10.gtf -o in_out *sorted.bam
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分享 数据处理流程
2017-11-25 21:26
1.trim galory去掉 adapt,分单端和双端的情况,也要注意是否有多种adapt 2.mapping到基因组上,STAR可以将RNA-seq比对到基因组。 3.cufflinks构建转录本,包含了当时细胞里所有mRNA。转录表达量用FKPM计算得到。 .gtf就是样品的转录组。 4.cuffmerge将多个实验组、对照组的转录组合并。 5.基因差异表 ...
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分享 CentOS 安装samtools 完美解决
2017-11-17 17:06
一般会报错: ../htslib/htslib.mk: 没有那个文件或目录 config.mk:34: ../htslib/htslib_static.mk: 没有那个文件或目录 make: *** 没有规则可以创建目标“../htslib/htslib_static.mk”。 停止。 bam_tview_curses.o bam_tview_curses.c bam_tview_curses.c:41:20: 致命错误:curses.h:没有那个文件或目录 # ...
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分享 trim galore
2017-11-16 00:20
cut adapt http://cutadapt.readthedocs.io/en/stable/installation.html http://www.bioon.com.cn/doc/showarticle.asp?newsid=68143 http://blog.sina.com.cn/s/blog_149f7b7da0102vn32.html &nbs ...
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分享 Fastq质量分数起源荧光记录数据中识别碱基
2017-11-10 19:50
Fastq格式是一种基于文本的存储生物序列和对应碱基(或氨基酸)质量的文件格式。最初由桑格研究所( Wellcome Trust Sanger Institute )开发出来,现已成为存储高通量测序数据的事实标准。以Illumina Casava 1.8+ 的fastq格式为例,fastq格式的形式如下: 每条序列由4行字符表示,上述样例显示有两条序列: ...
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分享 Duplicated Reads问题
2017-11-10 15:59
NGS数据的Duplication问题 一、什么是Duplicated Reads 1.谈到NGS数据的duplicated reads(暂且翻译为“重复数据”),我们通常会直观地认为:duplicated reads是在NGS文库构建过程中,由于PCR过度扩增导致同一个模板DNA片段被反复测序多次,得到一模一样的reads。 2.但是这经不起推敲。仔细一想,就很困惑 ...
个人分类: 所见所闻|3644 次阅读|没有评论
分享 c++ 、MATLAB 程序 发送邮件
2016-11-9 21:27
用过几年MATLAB之后,开始逐渐转向c++。MATLAB优点在于语法简单、系统自带的函数充足、数据可视化容易。缺点是除了矩阵相关操作外,速度较慢,在迭代、逻辑判断中更加明显。有时候这是无法避免的。c++速度就要快很多,支持多线程,其他方面就挺繁琐的了。 整理一下两者发送邮件的程序,在计算完成后通知我,对我 ...
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分享 泡利&玻尔&WY
热度 7 2016-1-6 11:55
泡利效应 实验课不及格这种小事简直是司空见惯,而whereis yang,where is bang( 哪里有杨振宁,哪里就有爆炸)之类的传说也早已流传多年。海森堡也似乎天生患有“显微镜恐惧症”,以至于博士答辩差点没过,提到显微镜的理想实验八成都有问题。 然而泡利大神一枝独秀,“泡利效应”让当时所有的实验家退避三舍。 ...
个人分类: 所见所闻|5706 次阅读|20 个评论 热度 7
分享 少年·青年·中年·老年
热度 3 2014-8-1 17:05
(一) 少年姓宁,今年十二岁,家住黑营窝。我中午看到他时,他正骑着一辆小自行车驼着两袋子啤酒瓶来卖。 满脸稚气,眼睛左边略小于右边,一颗牙齿长得也有点问题,穿着一条破烂的裤子,衣服还算干净,不过让我感到惊讶的是他的语言非常成人化或者说是社会化。 “叔叔,帮我抬一下。”, ...
2593 次阅读|7 个评论 热度 3

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GMT+8, 2019-12-12 02:47

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