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MapOptics: 一个轻量的、跨平台的光学图谱 alignment 数据可视化工具 2018-12-12
Bionano光学图谱可以在基因组组装的最后步骤辅助将 scaffold 序列锚定到染色体序列。但现有的可视化工具局限于Windows 操作系统,一般是为大尺度结构变异而开发 ...
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植物中 ABA 的功能 2018-12-10
上一篇博文《 植物激素有哪些种类 》中提到 ABA 是“脱落酸”的简称,那么ABA的功能就是促进植物叶片的脱落吗? ABA 在发现之初确实认为其功能为参与叶片的 ...
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植物激素有哪些种类 2018-12-06
最近有小朋友问我[并没有],植物激素有哪些种类? 在回答这个问题之前,首先解释一下什么是植物激素。植物激素是植物产生的浓度较低又很重要的信号分子, ...
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11 个生物分类拉丁名的翻译 2017-12-01
Ascomycota: 子囊菌门 Basidiomycota:担子菌门 Microsporidia:微孢子目 Bacillariophyta:硅藻门 Chlorophyta:绿藻门 Phaeophyceae:褐藻门 ...
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raxmlHPC-HYBRID-SSE3 使用笔记 2017-08-08
raxml 是一个利用最大似然法构建进化树的软件。因其在命令行下运行,支持在大型服务器上多线程运行,广受科研工作者认可和喜爱。但 raxml 参数特别多,往往令人 ...
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郁闷,数据被删了 2017-07-18
昨天很震惊地发现我们几个同学在一台服务器上的数据都不见了!!!这台服务器并非我们实验室所有,属于学校里的国家重点实验室。因这台服务器配置较高,有 2T ...
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密码子模型 Fequal, F1X4, F3X4 和 F61 是什么意思 2017-06-10
PAML 的 codeml 程序有一个关于密码子频率 (CodonFreq) 的参数的选项为 0: Fequal 1: F1X4 2: F3X4 3: F61 (codon table) 那么,这几个模型都是什么样的模 ...
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两个 .gz 文件是否可以直接合并 2017-06-07
这里的直接合并的意思是用 cat 名把两个文件并成一个文件,即, cat file1.gz file2.gz > merged.gz 答案是这样做是可行的。原因是 gzipped 文件是内部 ...
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