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多生态系统间同位素生态位差异比较: SIBER(SIBER)in R
梅卫平 2016-5-30 22:50
同步更新于自媒体,完整版请查阅: 新位置 https://cran.r-project.org/web/packages/SIBER/vignettes/Introduction-to-SIBER.html SIBER (SIBER package)是用来比较“两个生态系统之间”的同位素差异(overlap percentage)。 #-------- step1. Setting up our R session for this demonstrat ...
个人分类: 同位素|8817 次阅读|1 个评论
安装运行SIBER(in SIAR)时,如何解决 Error: not a matrix
梅卫平 2016-5-30 22:09
原创博文,谢绝转载 When tring SIAR (SIBER) however after entering this code: SEA.B - siber.ellipses ( dC , dN , group , R = reps ) error code occured: Error : not a matrix 问题解决方案请尝试: 这个方法
个人分类: R语言|4499 次阅读|没有评论
R或RStudio中如何撤销上一步操作
热度 3 梅卫平 2016-5-29 01:35
众所周知,ctrl + z 目前为止肯定不管用,只能寻找替代方案;R和Rstudio相比,推荐在Rstudio中写程序。 在Rstudio中,每一步代码在“history”栏都有记录,如果不小心写完一系列代码(简称代码a系列),最后一步代码b出错或不是你想要的结果,那么,直接在history栏 只选定 代码a系列➡to console➡按回 ...
个人分类: R语言|89207 次阅读|5 个评论 热度 3
物种生态位重复度计算:“SIBER” (SIAR package)分析in R
梅卫平 2016-5-27 00:10
# SIBER: Stable Isotope Bayesian Ellipses in R # “SIBER” (SIAR package)这个SIAR套件的SIBER分析,主要是用来比较一个生态系统内不同种群之间的同位素生态位竞争的具体百分比值,等等。 由于文本识别问题,查看本文代码及相应中文说明的完整版 请移步至: ...
个人分类: 同位素|8589 次阅读|3 个评论
用 R 简单作图 (plot in R) 的各项参数设置
梅卫平 2016-5-26 00:26
# step 1. plot plot(x, y, type = p, pch = NULL , bg = NA, cex = NULL, xlim = NULL,ylim = NULL, xaxt = NULL, yaxt = NULL, xaxs= NULL, yaxs= NULL, tck = NULL, main = NULL, sub = NULL, xlab = NULL, ylab = NULL, ann =par( ...
个人分类: R语言|7763 次阅读|没有评论
通俗易懂理解EA-IRMS装置概念图 Ver.2
梅卫平 2016-5-8 14:51
Step 1. 在元素分析仪(EA, Elemental Analyzer)(见图1)中: 预处理好的用 锡舟 (Tin capsule)包好的成分 未知 的 样品 ,放入自动进样器(Auto sampler); 未知样品掉入 燃烧管 ( Combustion Tube),经过高温燃烧(如1000℃以上),各成分变成氧化态(使用 Cr 2 O 3 作为氧化催化剂(oxidized cat ...
个人分类: 同位素|13298 次阅读|没有评论
Excel与Origin,R等软件对同一数据,进行y=a*x^b拟合时结果不一样
热度 3 梅卫平 2016-5-8 12:40
查看更多 在网上有看到 y = a*x^b 等 非线性拟合 结果不同的相关讨论,然后用自己的数据进行了验证,得到如下结果: 在 Excel 和 LibreOffice 上计算的结果相同,见 上 图 1 。 在 Origin 和 R 上计算结果相同,但和 Excel 和 LibreOffice 结果不同,见 下 ...
个人分类: 数据处理与统计分析|36370 次阅读|6 个评论 热度 3
Steel.Dwass test in R: Kruskal-Wallis post hoc test
梅卫平 2016-5-8 11:22
引子:非参数ANOVA方法常见为 Kruskal-Wallis test,它对应的事后分析或多重比较方法推荐使用Steel-Dwass test。 数据统计分析的 前提条件 十分重要而且很容易被忽略,比如数据是否 正态分布 ,多组数据间是否 方差齐性 ,等等,满足上述条件, 参数检验 OK ,否则,使用 非参数检验 。 可参考另一篇博文: 数据统计分 ...
个人分类: R语言|16716 次阅读|没有评论
如何作 " 协方差分析 (ANCOVA)" 之 R (或 RStudio)应用篇
热度 1 梅卫平 2016-5-8 09:53
简单应用来说, 协方差分析 (ANCOVA) 就是在R语言中表达为y~x+/*y 0, 其中 因变量y,协变量y 0 ,自变量x。然后,开始写代码咯 data.of.Wada2013.practice - read.csv(~data of Wada2013 practice.csv) View(data.of.Wada2013.practice) eco-data.of.Wada2013.practi ...
个人分类: R语言|21954 次阅读|5 个评论 热度 1
证明之“决定系数R^2与调整决定系数adjR^2的相互转换计算方法”
梅卫平 2016-5-7 22:40
决定系数R^2与调整决定系数adjR^2的定义请大家自行查阅相关文献或者中英文维基百科。 进入正题,开始“决定系数R^2与调整决定系数adjR^2的相互转换计算方法”的推导过程,各点说明如下。 点1. 各参数计算方式: 点2. 关于样本方差(sample variance 或 var(y) )的计算公式: 点3. ...
个人分类: 数据处理与统计分析|39632 次阅读|没有评论

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