将QIIME2学习进行到底 2019-02-13

qiime2-2019.1已经发布，程序稳定性越来越好，鉴于官方已经停止支持qiime1，有必要把qiime2的所有细节都理清，学好，这样才能对自己的数据进行实战分析，并将结 ...

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qiime2-2019.1更新学习笔记 2019-02-12

QIIME2 2019.1发布啦，继续紧跟步伐，看看更新了哪些内容，一并备忘。 这个发布生版本主要针对更新依赖环境，升级到了Python 3.6，一个新的 r-vegan Adonis vis ...

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基因检测之《生命的语言》读书笔记 2019-02-11

自从高中毕业选择生物工程专业入行，到研究生阶段微生物学的学习，再到工作开始做基因检测方面的工作，很庆幸基本上在生命科学领域学习和工作。每月去一次的图 ...

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肠型分析学习笔记 2018-12-29

肠型，Enterotype，是2011年在这篇文章中提出的，即将过去的2018年又有20多们肠道微生物的大佬对肠型的概念进行了回顾和确认。一直比较好奇怎样来用代码分析肠 ...

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[译]如何理解你的肠道微生物检测报告和数据 2018-12-21

https://www.vitamodularis.org/articles/how_to_interpret_your_microbiome_data.shtml 内容来自这篇文章，只是摘抄翻译了部分内容，英文好的直接出门左转到原 ...

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bioconductor新的安装方式 2018-12-18

今天学点R，发现bioconductor新的安装方式，于是记录一下，备忘。 1.bioconductor新的安装方式 废弃警告： Warning messages: 1: package  ...

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肠道微生物与结直肠癌文献阅读笔记 2018-12-17

阅读的综述翻译的中文杜标题是《肠道菌群失调促进结直肠癌的发生》，英文名为『Dysbiosis of gut microbiota in promoting the development of colorectal canc ...

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继续学习–生信 2018-12-12

最近从图书馆借了《生物信息学（第2版）》国防科大刘伟主编的，继续我的学习之路。我是图书馆有啥新书就借来读读，一来比较喜欢新书，二来这书好像也不怎么热， ...

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