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病毒序列整合到被子植物核基因组中，主要来源于Caulimoviridae和Geminidiridae两个病毒家族，这些序列是植物基因组重复序列的重要组成部分。大多数情况下，植物基因组中的病毒序列已经失活，主要受寄主内的基因沉默系统控制，如甲基化。EPRVs（endogenous pararetroviral sequences）序列属于Caulimoviridae家族，在异常情况下，如逆境等，少数完整的EPRVs序列能够环化，从植物基因组中游离释放出来，并重新获得插入活性，随机插入到寄主的基因组中，导致寄主基因组的扩增。

在基因组较小的拟南芥基因组（1C=157 Mbp）中，siRNAs介导的DNA甲基化，组蛋白修饰以及染色质重构（chromatin remodelling）等沉默机制，表观抑制其基因组中的重复序列的扩增，而维持较小的拟南芥基因组。Becher等通过低覆盖度基因组测序，研究冠花贝母（Fritillaria imperialis），一种具有超级巨型基因组（1C=42 096 Mbp，约为拟南芥的240倍）的被子植物，基因组内的EPRVs序列结构、分布和甲基化状态等，发现该植物基因组内EPRVs约有21000个拷贝，总长度约为162 Mbp，约为其基因组大小的0.4%。并且EPRVs序列的甲基化程度较高，受一类24nt smRNAs控制。

研究者推测，冠花贝母的超级巨型基因组内的表观基因沉默系统没有失灵，没有导致内源的病毒序列EPRVs的无限扩增，也不是造成冠花贝母具有超级巨型基因组的原因。

Becher, H., Ma, L., Kelly,L. J., Kovarik, A., Leitch, I. J., Leitch, A. R., 2014. Endogenouspararetrovirus sequences associated with 24 nt small RNAs at thecentromeres of Fritillaria imperialis L. (Liliaceae), a species with a giantgenome. The Plant Journal.

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.12673/abstract