潜龙在渊分享 http://blog.sciencenet.cn/u/genevalley 关键词:单细胞分析 合成生物学 光合微生物 藻 组学

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科研备忘录之一:细菌种间相互关系--无菌培养vs混养

已有 3144 次阅读 2011-7-30 06:30 |个人分类:自留地|系统分类:科研笔记

将来可能的一个很好的研究领域--快速笔记,以免遗忘

才读到今年MIT的Chisholm团队和2008年的2片文章,表明蓝藻和异养细菌一起培养,可以帮助提高蓝藻在琼脂糖平板上的克隆数目,以及大大提高在液体培养基中的生长速度(即便是在很低的起始细菌浓度之下,而这在单养的时候是不可能的),异养细菌的作用据文章说是跟氧胁迫有关,证据是一个缺乏catalase的异养细菌失去中促进作用,而在平板上补充catalase之后蓝藻能猛长。个人认为,很可惜这2片文章没有更多的分子证据来说明细菌之间相互关系的分子机制,而这正好是能使文章上几个档次的东西。

初步的计划是:
1)机制研究:混养,单养  --> 分离,RNA测序,代谢组学,基因knockout --> 相关途径 --> NS文章
还可以把当前的单细胞技术用到这个领域来。
2)应用研究:使得更多的目前无法培养的环境微生物得到实验室培养,开发剩下的98%海洋资源!

参考文献:
AEM,2008, p4530-4534 (IF ~3.5)
ISME J, 2011, 1-8 (IF ~6.4)


https://blog.sciencenet.cn/blog-600151-469959.html


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