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药物研发新概念:PAINS (假阳性化合物)

已有 8923 次阅读 2014-9-28 11:28 |个人分类:生物制药|系统分类:观点评述|关键词:PAINS,,假阳性化合物| PAINS, 假阳性化合物

    刚刚看到孙学军老师的博文新技术容易带来的虚假信息我大致看了一下英文原文,这篇文章涉及一个关键名词:pan-assay interference compounds, or PAINS这个名词我是首次听说,所以就查了一下,发现这个词是2010年才被发明的,可谓是药物研发领域的新概念,中文有人翻译为假阳性化合物。这篇首创论文的标题为:New Substructure Filters for Removal of Pan Assay Interference Compounds (PAINS) from Screening Libraries and for Their Exclusion in BioassaysPDF论文可在如下地址免费下载:

http://www.chm.bris.ac.uk/sillymolecules/pains.pdf

     此文作者的最大贡献是发现了10类有问题的化合物(假阳性,无成药前景),原句为“We summarize here our findings on each of these problematic compound classes. We conclude that at least 10 of these compound classes should be considered to be pan assay interference compounds, for which we have coined the acronym PAINS, and avoided as development options when furnished as screening hits.”

 这十类化合物为:rhodanines, phenolic Mannich bases,  hydroxyphenylhydrazones, alkylidene barbiturates, alkylidene heterocycles, 1,2,3-aralkylpyrroles,  activated benzofurazans,  2-amino-3-carbonylthiophenes, catechols, and quinones

也就是说通过高通量筛选出来的上述10类化合物就不用再费劲往下做了,因此可以大大降低先导化合物的假阳性率,假阳性是化学药研发人员的痛(PAINS), 所以这个PAINS (假阳性化合物)的英文缩写真可谓独具匠心。所以这个PAINS (假阳性化合物)的发现减轻了研发人员的痛,这对于药物筛选是非常重要的贡献,也可以为小分子化学药的开发节省大量研发费用。该文自从4年前发表以来,已经被引用了近300次,也说明该文是一篇重要论文。

   网上搜了一下,发现介绍PAINS (假阳性化合物)中文科普文章非常少,其中一篇为:药物筛选中的PAINS(假阳性化合物)  我在上述领域是外行,本文旨在抛砖引玉,期待内行有更多的详细介绍。本来打算将本文贴在孙老师文末作为评论,无奈内容较多,并且感觉这个话题也似乎比较重要,所以干脆单独贴在自己博客中。



http://blog.sciencenet.cn/blog-563591-831453.html

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