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使用Image J 合并彩图 Merge images (第五弹)
热度 1 陆绮 2015-1-9 01:06
这一步很简单 -creat merge file Image – color – merge channels-choose imorting channels fordifferent colors-click OK 不同的颜色选择相应的文件,比如如下图例子中的Max_iamge.ids-C=1文件我想使其显示红色: 点击OK就可出现merge后的彩色图像 同样的要把输出的彩色图像名字为compo ...
个人分类: 活色生香de生物科学|65007 次阅读|1 个评论 热度 1
使用Image J打开confocal 文件后的加假彩色(ImageJ使用第四弹)
热度 1 陆绮 2015-1-9 00:52
打开confocal 文件后,一般需要叠加起来 -image → stack →Z project… 叠加完成后是黑白图像,可根据需要赋予假彩色: - image → color → channel tool → more red /green /blue 点击Channels Tools出现以下 可以选择红蓝绿等 ...
个人分类: 活色生香de生物科学|87063 次阅读|1 个评论 热度 1
如何用Image J打开confocal 文件 .ids (Image J使用第三弹)
陆绮 2015-1-9 00:29
-在NIH网页上下载Image J软件并安装 http://rsbweb.nih.gov/ij/download.html -下载插件 LOCI Tools bundle 插件名为“loci_tools.jar” http://www.loci.wisc.edu/ome/formats-download.html 在自己电脑里找到imageJ的 安装地址,一般在program file-Image J 文件夹内,把插件 loci_too ...
个人分类: 活色生香de生物科学|30509 次阅读|没有评论
来吐槽一篇刚刚发表在顶级杂志Neuron 的 文章
热度 21 陆绮 2014-3-13 14:13
这是一篇刚刚发表在2014年二月号的NEURON杂志的文章: Tochitsky I, Polosukhina A, Degtyar VE, Gallerani N, Smith CM, Friedman A, Van Gelder RN, Trauner D, Kaufer D, and Kramer RH. Restoring Visual Function to Blind Mice with a Photoswitch that Exploits Electrophysiological Remodeling of Retinal ...
个人分类: 活色生香de生物科学|21219 次阅读|44 个评论 热度 21
如何绘制箱线图(Box-& Whisker Chart)
热度 5 陆绮 2014-2-25 11:50
如何绘制箱线图(Box--Whisker Chart) 厚颜无耻的人肉翻译机小水獭又活奔乱跳滴跳出来了,本獭看到一篇文章上使用了箱线图(box--Whisker Chart)来表示数据的分布,觉得很帅,于是想要学着画一张.可惜Excel不给力啊 不能直接画,还需要转换一下数据值.于是用google百度了一下,网络世界真是能人辈出啊,学会以后为了今 ...
个人分类: 活色生香de生物科学|55298 次阅读|8 个评论 热度 5
使用Image J进行自动荧光定量分析(二) 细胞膜荧光定量方法
陆绮 2014-2-5 02:04
Quantificationof fluorescence intensity by ImageJ for HEK cell 细胞膜区域荧光定量分析 http://www.unige.ch/medecine/bioimaging/tricks/imagejtutorials/Quantification.pdf Wang H, Sugiyama Y, Hikima T, Sugano E, Tomita H, Takahashi T, Ishizuka T, and Yawo H. Molecular determinants diffe ...
个人分类: 活色生香de生物科学|31394 次阅读|没有评论
为什么眯眯眼可以看得更清楚?
热度 13 陆绮 2013-10-14 23:55
现象: 我是一个近视眼,小学的时候看不清楚黑板上的字就学会了眯眼睛.确实眯一下,模糊的字会清楚一些.眯眯眼的英文单词是squint, 释义为look with the eyes partly closed. 原因 :最主要的原因类似于照相机的大光圈小景深,缩小光圈可以得到更深的景深.虹膜的放大和缩小可以改变光圈的大小,可是只对光强起反应.在恒定 ...
个人分类: 活色生香de生物科学|18213 次阅读|25 个评论 热度 13
使用Image J进行自动荧光定量分析
热度 14 陆绮 2013-10-3 03:59
在这里我整理我最近使用ImageJ软件自动数细胞以及定量分析荧光强度的步骤. ImageJ的主面板: 打开文件 File → Open →’.zvi’ 先把2D的所有图叠加起来,选项选max intensity Image →stacks → 3D project 复制一张图: Image →duplicate 调整 Th ...
个人分类: 活色生香de生物科学|136357 次阅读|24 个评论 热度 14
Optogenetics 光控基因技术系列 (二) 光敏蛋白结构
热度 3 陆绮 2013-9-3 13:06
Optogenetics 光控基因技术系列 ( 二 ) 光敏蛋白结构 在神经生物学中,受体一般分为两类: 离子通道和化学偶联受体,比如G蛋白偶联受体GPCR. 有眼睛这一感光器官的动物中,感光受体为G蛋白偶联受体rhodopsin和melanopsin. 但是低等的绿藻蓝藻等植物上,有受光子激活的离子通道.这是非常令人激动的,这意味着 ...
个人分类: 活色生香de生物科学|19889 次阅读|9 个评论 热度 3
Optogenetics 光控基因技术系列 (一)
热度 4 陆绮 2013-9-3 09:36
Optogenetics 光控基因技术系列 ( 一 ) Optogenetics 在 wiki 里面翻译为光遗传学 , 我没有异议 . 但是在这里我更想把它翻译为光控基因技术 .Optogenetics 的从几篇文章到现在成为一个热门的领域经历了大概 10 年时间 . 有大概几个研究方向 : 第一是研究各类生物中自身表达的光敏蛋白的功能 ...
个人分类: 活色生香de生物科学|21129 次阅读|15 个评论 热度 4

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