分子匹配叠合及两种冰的结构异同

李继存 2013-8-24 07:28

分子匹配叠合及两种冰的结构异同 2013-08-20 18:47:50 初稿 2013-08-30 18:26:50 修订错误 最近完成了两个小工具，一个可用于两个分子内原子之间的一一匹配，另一个可用于将两个已匹配好原子的分子进行最佳叠合。对于前者，若是不依赖于一些先验的知识或是采用近似，其实是个 NP 问题，原子个数一多就 ...

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取整截断函数及其在PBC中的使用

李继存 2013-8-17 07:47

取整截断函数及其在PBC中的使用 2013-08-13 14:05:39 取整和截断相关的函数，有着各种不同的名称，不同的定义，很容易让人迷惑。它们之间根据具体情况还可以相互转换成不同的写法，更增添了混乱。下面整理 Fortran 和 C 中的相关函数。 函数 Fortran C 向下取整 ...

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坐标轴刻度范围及刻度值的设定

李继存 2013-7-24 06:58

坐标轴刻度范围及刻度值的设定 2013-07-23 09:33:26 数据作图时，纵横坐标轴刻度范围及刻度值的取法，很大程度上取决于数据的分布。对某一组数据，我们很容易就能知道如何选取这些值才能使图画得漂亮。但是要想找到一个通用的算法，用以对任意分布的数据决定这些值，并不是一件容易的事。下面是我在网上找到的一些 ...

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命令行语法格式及特殊字符

李继存 2013-7-23 06:27

命令行语法格式及特殊字符 2013-07-11 09:29:06 在描述命令行参数的时候，对其格式有些约定俗成的写法，各系统之间也有差别。一般采用的格式如下： 命令 必选参数 1| 必选参数 2 {( 默认参数 )| 参数 | 参数 } 命令格式中常用的几个符号含义如下 ...

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​Jmol的select命令

李继存 2013-6-28 07:54

Jmol 的select命令 2013-06-24 08:54:31 Jmol 是我经常使用的一款分子结构查看软件，其原因主要有下面几点： 1. 默认显示的图形看着比较舒服，中我的意 2. 旋转，缩放，测量，播放等基本功能使用符合习惯，比较方便 3. 脚本等高级功能也很强大，虽然我用到的不是很多 最 ...

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