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Fortran可变输出格式
李继存 2014-8-19 22:32
# Language : fortran integer i , ni real * 8 x ( 1000 ) character * 80 OUTFMT x = 0 . d0 ni = 30 ! 方法一: 用足够大的值 write ( * , 100 ) ( x ( i ) , i = 1 , ni ) 100 format ( 1000 ( 1x , F18 .6 ) ) ! 方法二: Ifort的扩展格式 write ( * , ...
个人分类: 我的工具箱|3258 次阅读|没有评论
markdown在计算化学领域的扩展应用
李继存 2014-8-19 22:27
markdown是纯文本格式, 轻量级, 方便管理查找, 适合用于书写文档, 整理资料, 工作展示. 对我熟悉的计算化学领域, 我觉得可以进行一些扩展, 方便其使用. 数学公式 MathJax可能是大多数人的选择 代码高亮加色 有很多的js工具可实现 幻灯片展示 最简单的解决方式就是插入一段js代码, 利用其它js工具的方法就很多了 ...
个人分类: 我的工具箱|4308 次阅读|没有评论
jdx光谱数据格式整理脚本
李继存 2014-8-3 07:59
NIST Chemistry WebBook 可以查到许多物质的红外光谱, 这些光谱数据以jdx格式给出. 下面的脚本可用于将jdx格式的光谱数据转成普通的格式, 以便用于作图. # Language: bash awk '' BEGIN { Ytrs = 0 } / YUNITS = TRANSMITTANCE / { Ytrs = 1 } / XFACTOR / { sub ( / . + = / , ...
个人分类: 我的工具箱|5094 次阅读|没有评论
全排列输出算法
李继存 2014-8-3 07:55
下面的代码用于生成几个数据的全排列, 在有些时候需要用到, 当然元素个数不要太多. # Language: bash awk ' BEGIN { Ndat = 5 ; for ( i = 1 ; i = Ndat ; i ++ ) p = i ; for ( i = 1 ; i = Ndat ; i ++ ) printf ( %3d , p ) print ; ...
个人分类: 我的工具箱|2287 次阅读|没有评论
VASP使用
李继存 2014-7-19 04:53
VASP的使用方法设计的缺陷很大, 如果只是简单算个东西, 倒也可以, 若是想大规模使用, 成千上百的文件, 都有着一样的名字, 看了不疯才怪. 所以, 我们需要一个脚本, 将VASP计算的流程进行改造. 改造的原则是支持不同文件名, 且不同文件之间可任意组合. 创建赝势文件POTCAR的脚本 整理好四种赝势文件, uspp.LDA, uspp.GGA ...
个人分类: 我的工具箱|7409 次阅读|没有评论
GNU Parallel
李继存 2014-7-19 04:51
简单的并行, 可使用GNU parallel. GNU parallel是一个perl脚本, 只要设置好路径, 即可使用. 安装 到 GNU官网 下载最新版本 解压, 得文件夹parallel-20140522 参考README编译安装 非root用户, 参照Personal installation 直接使用, 参照Minimal installation, 将脚本复制到目标路径即可. 使用 官方文档, parall ...
个人分类: 我的工具箱|4233 次阅读|没有评论
NICS计算及其图示
李继存 2014-7-19 04:50
使用PQS计算NICS(Nuclear Independent Chemical Shift), 示例输入文件(环丁二烯)如下 TEXT=Cyclobutadiene NICS dense grid for visualizationGEOM=PQS SYMM=0.0c -0.793380 -0.661025 0.002932h 1.560349 1.4230 ...
个人分类: 我的工具箱|7540 次阅读|没有评论
Jmol的扩展xyz文件格式
李继存 2014-7-19 04:48
与原始格式相比, Jmol所支持的xyz格式有所扩展 Jmol xyz格式 1 2 3 4 5 6 7 8 Natm Tips Sym x y z Sym x y z vibX vibY vibZ Sym x y z FormalCharge(integer)/PartialCharge(decimal) Sym x y z FormalCharge(integer)/PartialCharge(decima ...
个人分类: 我的工具箱|6653 次阅读|没有评论
markdown幻灯片
李继存 2014-7-19 04:47
利用Markdown和DZslice制作的幻灯片, 适合用于网上课件展示. ◆图片/表格/公式/代码完整版请参 看: markdown幻灯片 ◆
个人分类: 我的工具箱|2769 次阅读|没有评论
UTF-8符号
李继存 2014-7-19 04:46
UTF-8符号 # 00 01 02 03 04 05 06 07 08 09 0 �         1       2           3   ! # $ % ' 4 ( ) * + , - . / 0 1 5 2 3 4 5 6 7 8 9 : ; 6 = ...
个人分类: 我的工具箱|2441 次阅读|没有评论

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