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使用Notepad2查看编辑GROMACS文件
李继存 2015-4-16 03:05
2015-04-14 20:52:38 在运行GMX的时候, 经常需要查看编辑相关文件, 这些文件主要分为两类, 文本文件和结构轨迹文件. 文本文件主要是运行的输入文件*.gro, *.top, *.ndx, *.mdp和输出文件*.log, *.xvg. 这些是查看编辑次数最多的文件. 为了查看的时候直观方便, 建议尽量不要使用Windows系统自带的记事本, 而是使用支持语法高 ...
个人分类: 我的工具箱|2446 次阅读|没有评论
碳纳米管的构建方法
李继存 2015-4-14 20:27
2015-04-13 20:59:31 看到一篇老的文献 Helical and rotational symmetries of nanoscale graphitic tubules, PRB, 1993, 47, 5485 , 介绍了纳米管的构建方法, 就研究了一下, 弄明白了, 记在这里, 顺便写了个在线的小工具, 方便使用. 如果你在使用过程中发现问题, 欢迎告知$.$ 理论基础 碳纳米管可由石墨烯沿某一方向卷 ...
个人分类: 我的工具箱|3343 次阅读|没有评论
网络在线文档的下载
李继存 2015-3-10 04:05
2015-03-09 14:44:50 网上的在线文档有许多需要积分才能下载. 我对此颇有微词, 就不在这里说了. 网上也有一些免积分下载在线文档的软件, 如冰点文库和豆丁下载器之类, 但使用的时候不时会出现问题. 我了解了一下这些软件的原理, 发现它们采取的方式大概是先得到swf文件, 然后转成图片, 再处理得到文本或是转成pdf保存. 这 ...
个人分类: 我的工具箱|2352 次阅读|没有评论
【转】世界上最难的语言
热度 2 李继存 2015-2-26 10:55
2015-02-25 20:21:08 【按】前面有篇 博文 介绍了在markdown中使用流程图的办法, 最近发现了一个更强大的工具 GraphViz , 也有 JS的实现Viz , 就拿下面的趣闻来试验下效果吧. 对GraphViz感兴趣的可参看啄木鸟的简单介绍: 在维基中使用 Graphviz . 原图 当一个人听不懂另一个人在说啥的时候,他会怎么发牢骚呢? 各国 ...
个人分类: 我的工具箱|9485 次阅读|6 个评论 热度 2
Origin7.5SR7中文版
热度 1 李继存 2015-2-23 05:32
2015-02-22 14:49:20 在科技绘图领域, OriginLab公司的 Origin 是使用非常广泛的一款软件. 大部分做科研的人多少都接触过这个软件, 功能我也就无须多说了. 网络上关于Origin的资料和教程很多, 各种各样的, 也有人专门出版过一些参考书籍, 听说有的学校还开设过相关的课程. 可惜的是, 我至今还没有见到过比较好的中文版Or ...
个人分类: 我的工具箱|2431 次阅读|2 个评论 热度 1
【转】原理动画
热度 3 李继存 2015-2-18 05:15
2015-02-17 15:04:002015-02-28 16:35:03 感谢郭奕棣老师提供更多素材2015-03-07 22:40:52 增加整理更多网络资源 现代生活离不开各种机械, 无数复杂的机械走进了我们寻常百姓的生活中, 小到我们家里客厅墙上的挂钟, 大到出门上班用以代步的汽车, 都离不开机械在其中默默的工作. 不知道你有没有偶尔想问, 究竟是什么样的机械 ...
个人分类: 我的工具箱|27413 次阅读|10 个评论 热度 3
轨道查看器OribitalViewer汉化版
热度 1 李继存 2015-2-3 10:35
2015-02-02 08:51:05 轨道查看器 Oribital Viewer 可用于查看类氢原子的各种轨道及其线性组合成的轨道. 在学习结构化学或量子化学时, 可以使用这个软件熟悉各种轨道, 并获得感性认识, 对理解抽象的原子轨道很有帮助. 轨道查看器是一个很小巧的程序, 但功能强大, 可惜的是已经好久好久没有更新了. 不过单以它目前的功能, ...
个人分类: 我的工具箱|1726 次阅读|2 个评论 热度 1
我使用的markdown工具
热度 1 李继存 2015-1-17 11:51
2015-01-13 11:30:42 我在几篇博文中都介绍了markdown, 自己使用它来做工作记录也已经有一段时间了. 现在就将我所用到的工具介绍一下, 供需要的人参考. markdown基础 可参考我以前的几篇 博文 . markdown使用流程 我使用的流程如下: 使用时, 需要编辑文本文件File.md(文件名只能使用英文字符), 因此需要一个文本 ...
个人分类: 我的工具箱|6325 次阅读|1 个评论 热度 1
gnuplot作图时插入LaTex公式
李继存 2015-1-5 06:32
2015-01-04 16:20:48 马欢曾在一篇 博文 讲过作法, 但我想最终存为png格式的图片, 所以实验了几种不同的作法. gnuplot的终端可以直接输出LaTex文件, 其中文字和画图部分是分离的. 有了tex文件后, 可以采用下面的方法转成png图片. 利用latex转成dvi文件, 然后利用dvipng转成png 利用pdflatex转成pdf文件, 再利用下面 ...
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