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Endnote小技巧
郭军 2020-5-26 20:08
我喜欢网盘,尤其喜欢它的同步功能,再也不用背着笔记本或揣着闪盘上班了。如果文件夹没能及时同步,也会给工作带了麻烦。这不,今天出现endnote文件夹没能同步, 有的 参考文献属于travel libaray。如何将travel library的文献挑出了?见下图. 麻烦有时也是好事,给你一次学习机会:-)
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Endnote:在 (author,year)与author(year)之间自由转换
郭军 2017-11-24 10:03
好久没发博文了,今天来除草 写文章时,如果主语是引用文献作者,期刊编辑一般要求是作者(年)格式,如“ Ragognetti etal. (2015 ) found that the heritability of tibia length was .....而不是“ Ragognetti et al. found that the heritability 。。。(Ragognetti et al. 2015) ”。问题是 ...
个人分类: 其它|1897 次阅读|没有评论
计算蛋总重
郭军 2017-1-19 14:29
计算蛋总重(egg mass)是一项耗时费力的工作,需要每周平均蛋重(egg weight or egg size)乘以周产蛋数,然后累加。本文介绍两个小技巧,用于蛋总重计算。 1. 内插法补齐缺失记录,或者预测新插点数值。 完美生产记录可遇而不可求。有的个体缺失蛋重记录,有时缺少整周蛋重记录。对于这些只有产蛋记录的个体,可 ...
个人分类: 遗传评估|1900 次阅读|没有评论
修复ubuntu系统不识别U盘
郭军 2016-12-22 12:57
重装linux系统之后,意想不到的事情接连发生,真是按倒葫芦又起瓢!这不,ubuntu不识别我的U盘。 问过度娘后,应该是U盘没有自动挂载,但是dev和usr都没有sdb文件夹。经过一番摸索后,找到解决办法: 就是重启系统时,选择ubuntu高级选项,通过recovery model修复系统!
个人分类: 其它|2687 次阅读|没有评论
畜禽遗传评估(3)显性遗传效应
郭军 2016-11-21 20:59
剖分显性遗传效应的意义在于:A.准确估计遗传力。部分显性遗传效应混杂于加性遗传方差之中,影响遗传参数估计及育种值排序。B. 利于配套系选育。如果性状的显性效应利于产品升值,比如蛋鸡的蛋重,可以放在父系选育。这样,不仅节约生产成本,商品代蛋重也得到改善。畜禽育种规划传统方法通常只考虑加性遗传效应,因为加 ...
个人分类: 遗传评估|1832 次阅读|没有评论
利用plink转换AGCT为1234
郭军 2016-11-19 11:49
我的博文主要是分享一些数据处理技巧,并非真正的知识。等到有了大块时间,再与大家共享值得记忆的知识。 做GWAS分析时,多需要haploview 获取linkage disequilibrium参数。这是一项烦躁的工作,需要将AGCT逐个替换成1234。偶然间,发现plink有一个命令可以直接转换输出序列为1234格式。 这个命令就是 【--allele1 ...
个人分类: 序列编辑|1592 次阅读|没有评论
Genbank 批量查找snp信息
郭军 2016-10-31 14:39
最近忙于GWAS结果整理,茶饭吃起来都不香。屋漏偏逢连夜雨,Genbank偏偏把鸡基因组数据更新到5.0,要知道 Affymetrix给我的可是4.0版数据。为了方便读者,我的文章应提供基于5.0版的结果。好在我利用半天时间找到ncbi提供的批量转换snp入口: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/batchquery.html 页面最下端不显 ...
个人分类: 序列编辑|1913 次阅读|没有评论
畜禽遗传评估(2)母体遗传效应
郭军 2016-10-6 10:33
畜禽一些重要经济性状,比如体重,受母本遗传效应影响。母体遗传方差占比较小,然而如果不将其从表型方差中剖分,会导致加性遗传方差估值偏高,进而影响育种值排序。 解析母体遗传效应的模型比较简单,唯一值得考虑的是母体遗传与加性遗传是否存在协方差。有的学者认为,两者之间的协方差是统计误差或群体层化,可以忽 ...
个人分类: 遗传评估|1854 次阅读|没有评论
畜禽遗传评估(1)两性状随机回归模型
郭军 2016-9-20 16:05
有些性状可以重复测量,例如身高,可以每隔半年测一次,也可以每天测一次,只要你不嫌烦 这类多次测量的性状称为动态性状,也称经向性状(longitudinal traits)。动态性状在统计处理时以自身为对照,利于减少环境误差、提高统计效率(power)。畜禽遗传评估时经常遇到动态性状,例如奶牛产奶量、蛋鸡产蛋数、山羊绒长度、 ...
个人分类: 遗传评估|1848 次阅读|没有评论
R: 遗传相关系数
郭军 2016-9-14 14:26
【cov2cor】,以前用过这个命令,今天想用时忘记了,把R和matlib折腾半天,没有结果 只好在excel手动计算,太费事。 网上搜索,在wiki重新得到这个命令。 顺便鄙视baidu,太垃圾,还是google好。
个人分类: R|1397 次阅读|没有评论

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