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Genbank 批量查找snp信息

已有 1914 次阅读 2016-10-31 14:39 |个人分类:序列编辑|系统分类:科研笔记

最近忙于GWAS结果整理,茶饭吃起来都不香。屋漏偏逢连夜雨,Genbank偏偏把鸡基因组数据更新到5.0,要知道 Affymetrix给我的可是4.0版数据。为了方便读者,我的文章应提供基于5.0版的结果。好在我利用半天时间找到ncbi提供的批量转换snp入口:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/batchquery.html

页面最下端不显眼处有一递交格式选项:

我选local snp ID选项,其格式为:

DWBURT|AX11111111

DWBURT|AX32222222

DWBURT|AX33333333


如愿,得到相应rs编号。




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