楚王好细腰，水稻爱“高腰”

曹务强 2018-5-6 21:12

《墨子·兼爱》中记载：“昔者楚灵王好士细腰，故灵王之臣皆以一饭为节，胁息然后带，扶墙然后起。比期（jī）年，朝有黧（lí）黑之色。”这就是我们常说的“楚王好细腰”的典故。唐朝大文豪白居易更是有“樱桃樊素口，杨柳小蛮腰”此等脍炙人口的诗句广为流传。由此可见，我们对细腰的痴迷古已有之，且源远流长 ...

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乙烯和“猫胡子”的那些事儿

热度 3 曹务强 2018-3-28 23:02

乙烯，是一种由两个碳原子和四个氢原子组成的神奇气体。它不仅是重要的化工原料，被广泛用于纤维、橡胶、塑料、乙醇等材料的化学合成，还是一种特殊的植物激素，在维持植物的生长发育，促进果实的成熟，影响植物对盐、病虫害等胁迫的抗性方面起到非常重要的作用。 “猫胡子”，没错儿，就是各位铲屎官们再熟悉不过的喵 ...

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使用MutMap快速定位突变基因：实战篇

热度 1 曹务强 2018-3-27 17:25

通过前面两篇文章对MutMap原理和分析流程的介绍，我们对MutMap的分析已经有了比较深入的了解，是时候来点儿数据实战一下了！ MutMap的发明者已经搭建好了一套Pepline，并写好了MutMap pipeline framework供大家免费使用。我们只需要将数据按照要求进行放置和命名，并通过非常简单的几个命令，将任务提交给服务器，经过三 ...

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使用MutMap快速定位突变基因：流程篇

曹务强 2018-3-26 17:53

在上一篇文章《使用MutMap快速定位突变基因：原理篇》中，我对MutMap的原理进行的简单的介绍。在本篇教程中，我会对MutMap分析的流程及分析过程中使用到的软件及其参数的设置进行逐一的分解，以求对MutMap的分析流程有更深入的理解。 1.对重测序数据进行质控，挑出高质量的reads （1）使用软件：FASTX-Toolkit ① f ...

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使用MutMap快速定位突变基因：原理篇

曹务强 2018-3-25 23:05

缘起 在我的课题中，我们使用了BSA结合全基因组重测序的方法寻找候选基因。本人乃生信小白一枚，可是对生物信息学非常感兴趣，一直想学一些生信分析。索性就以此为切入点，开始了自学生信的漫漫长路。从最简单的Linux操作，到生信软件的安装和使用，又学了一点Perl、Python和R的语法，花费了近两个月的课余时间（主要是 ...

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