水稻重测序2011-PLoS Genetics（ Roles of Domestication gene）

简建波 2011-6-14 18:08

水稻重测序 2011-06-09—PLoS Genetics Two Evolutionary Histories in the Genome of Rice: the Roles of Domestication Genes He Z, Zhai W, Wen H, Tang T, Wang Y, et al. (2011) Two Evolutionary Histories in the Genome of Rice: the Roles of Domestication Genes. PLoS Genet 7(6):e1002100. ...

3193 次阅读|没有评论

2011-06-09-PLoS Genetics（mouse 转录组与蛋白质组比较分析）

简建波 2011-6-14 10:40

Ghazalpour A, Bennett B, Petyuk VA, Orozco L, Hagopian R, et al. (2011) Comparative Analysis of Proteome and Transcriptome Variation in Mouse. PLoS Genet 7(6): e1001393. Abstract:在哺乳动物中，转录水平与它们编码的蛋白水平之间的关系还没有全面的研究，虽然以前在植物和酵母中的研究发现令人 ...

3694 次阅读|没有评论

环境与气候决定蜻蜓分子水平多态性和遗传群体结构

简建波 2011-6-10 13:08

Wellenreuther M, Sanchez-Guillen RA, Cordero-Rivera A, Svensson EI, Hansson B (2011) Environmental and Climatic Determinants of Molecular Diversity and Genetic Population Structure in a Coenagrionid Damselfly. PLoS ONE 6(6): e20440. genetic population 蜻蜓 PLoS one.pdf ...

2966 次阅读|没有评论

Reference-guided assembly

简建波 2011-6-8 12:13

参考基因组的作用之一，应用已有的reference 做骨架用于后期的其它个体的组装。研究显示Reference-guided assembly 将能够起到比de novo组装更加好的效果。近期PNAS的一篇关于拟南芥的paper显示出Reference-guided assembly 效果非常不错。 Reference-guided assembly of four diverse Arabidopsis thalia genomes. ...

5797 次阅读|没有评论

突变体

简建波 2011-6-2 15:40

突变体是某个性状发生可遗传变异或某个基因发生突变的生物体材料。在遗传分析中，为了获得某一组分的功能，而将其敲除形成的个体叫做 突变体 。 长期以来，育种学家们一直在尽力地发现和分离一些有价值的变异材料，以增加遗传材料或进行功能基因注释。早期的遗传学家和育种学家们主要是在自然界中 ...

14270 次阅读|没有评论

RAD-Seq:RAD-Seq for mRNA------eRAD(expression RAD)

简建波 2011-6-1 17:59

RAD-Seq has been identified a powerful tool in DNA level research. But, in recently, some reseachers focus onRAD-Seq application in RNA level. Such as, in mRNA, RAD-Seq maybe can also very useful in eQTL research.So, it can be called eRAD(expression RAD). ...

11318 次阅读|没有评论

NAM(Nested association mapping）群体

简建波 2011-5-30 16:00

NAM群体主要是通过多个亲本与同一亲本进行杂交，而后进行不断自交，获得一个庞大的作图群体。其优点在于亲本数目相对较少，而其中一个亲本固定的，在群体结构上有相对比较好的区分，在进行关联分析的过程中，可以考虑到群体结构造成的影响，从而很好的进行研究。 NAM群体的成功归功于玉米NAM群体的 ...

22928 次阅读|没有评论

MAGIC(Multiparent Advanced Generation Inter-Cross)作图群体

简建波 2011-5-30 15:10

MAGIC(Multiparent Advanced Generation Inter-Cross)：魔术（magic）一般的作图群体。MAGIC：多亲本高级世代互交系。MAGIC是一种比我们通常用的F2、RIL、CSSLs（两个亲本获得）等作图群体更为复杂的作图群体。但是MAGIC的一个重要特点正是因为其应用了多亲本互交，由此不会出现后代多态性下降， ...

14583 次阅读|没有评论

RAD-Seq: Genome scaffolding

简建波 2011-5-24 18:27

Genome researchis very popular because the costofhighthrough-put genome sequencingbecame very low.AfterGenome De novoassemble, we can justobtainmany scaffolds. It is difficult for us to study with so many scaffolds, andhow assemble t ...

4398 次阅读|没有评论

本页有 1 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏