Ecological and Conservation Genomics

简建波 2013-6-9 12:58

With the develpment of sequencing technology and experimental protocol, more and more ecological and conservtion researchers have used genomics tools decoding the problem of the ecology and conservation. With the ecological and genomics informations of the threatened species, it maybe very useful ...

个人分类: 未分类|6351 次阅读|没有评论

SNP分型技术之四：Sequenom MassARRAY

简建波 2011-1-15 17:14

SNP分型的方法多种多样，MassARRAY 分子量阵列技术是Sequenom公司推出的世界上领先的基因分析工具，通过引物延伸或切割反应与灵敏、可靠的MALDITOF质谱技术相结合，实现基因分型检测。基于MassARRAY 分子量阵列平台的iPLEX GOLD技术可以设计最高多达40重PCR反应和基因型检测，实验设计非常灵活，分型结果准 ...

个人分类: 未分类|35938 次阅读|没有评论

玉米gwas

热度 1 简建波 2011-1-11 12:07

一个研究组织近日在nature genetics连续发表两篇关于玉米GWAS paper，这是农作物中继水稻gwas后的又一农作物 应用 gwas挖掘功能基因。 Genome-wide association study of leaf architecture in the maize nested association mapping population http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/pdf/ng.746.pdf ...

个人分类: 未分类|5761 次阅读|1 个评论 热度 1

二项分布和多项分布

简建波 2011-1-4 14:24

二项分布 (Binomial Distribution) 二项分布即重复n次的伯努里试验。在每次试验中只有两种可能的结果,而且是互相对立的，是独立的,与其它各次试验结果无关，结果事件发生的概率在整个系列试验中保持不变,则这一系列试验称为伯努力试验。 多项分布：定义把二项分布公式再推广，就得到了多项分布（在一般概率书 ...

个人分类: 未分类|19919 次阅读|没有评论

最大似然估计法

简建波 2011-1-4 13:43

极大似然估计法是求估计的另一种方法。它最早由高斯提出。后来为费歇在1912年的文章中重新提出，并且证明了这个方法的一些性质。极大似然估计这一名称也是费歇给的。这是一种上前仍然得到广泛应用的方法。它是建立在极大似然原理的基础上的一个统计方法，极大似然原理的直观想法是：一个随机试验如有若干个可能的结果A，B ...

个人分类: 未分类|44947 次阅读|1 个评论

SNP分型技术之三：巢式PCR-RFLP

热度 1 简建波 2010-12-31 17:54

PCR-RFLP技术是一类应用很早的分型技术，其特点是便宜廉价，适合于实验室做个小实验什么的，但是其只能用于酶切位点的改变的分型，而巢式PCR-RFLP技术相对来讲，应用等各方面就改进了非常之多，巢式PCR-RFLP基因分型技术，不同于传统的只能对于有酶切位点的传统的SNP分型的技术，巢式PCR-RFLP是针对任 ...

个人分类: 未分类|4967 次阅读|没有评论 热度 1

火鸡（遗传图谱）SNP based linkage map of the turkey genome

简建波 2010-12-31 17:34

火鸡 即吐绶鸡(turkey)。鸡形目吐绶鸡科吐绶鸡属的一种； 是一种重 要的农业物种，对世界家禽肉制品生产的贡献居第二位。 火鸡基因组2010年发表在PLoS Biology，应用Roche 454和illumina技术相结合测序组装出火鸡的基因组草图，Contig N50 为12.6kb，Scaffold N50 为1.5Mb，而遗 ...

个人分类: 未分类|5835 次阅读|1 个评论

SNP 分型技术之二：PCR-RFLP

简建波 2010-12-29 13:36

个人分类: 未分类|4143 次阅读|没有评论

本页有 2 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏