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Gaussian的IRC计算的常用关键词
丁迅雷 2018-5-4 08:08
# b3lyp/def2tzvp geom=allcheck guess=read IRC(rcfc,recalc=5,stepsize=30,LQA,maxpoints=100,Reverse) 或者IRC(rcfc,recalc=5,stepsize=5,LQA,maxpoints=100,Forward) 注意stepsize是IRC的步长(默认是10,为0.1bohr),不要和优化结构时使用的步长参数 maxstep混淆了。 细节参考sob大神的 http://s ...
个人分类: Gaussian|4721 次阅读|没有评论
def2-tzvp基组加弥散的方法,弱相互作用计算
丁迅雷 2016-8-24 11:21
量化大神sobereva的帖子(http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthreadtid=3487extra=)指出: Truhlar等人提出一种通用的给出原本不含弥散函数的基组以最低限度的弥散函数的策略,这样的基组以ma-开头,含义是minimal augmentation,详见J. Chem. Theory Comput., 7, 3027、Theor. Chem. Acc., 128, 295 ...
个人分类: Gaussian|10533 次阅读|没有评论
Win下G09任务批处理
丁迅雷 2014-9-16 13:15
1. 编辑系统的环境变量PATH,多加一个位置 C:g09w (就是你的g09安装的目录),与前面已有的目录之间用分号隔开。 2. 在一个文件夹下,准备多个gjf文件,比如t1.gjf, t2.gjf, t3.gjf. 3. 用文本编辑器编辑脚本文件 run.bat 如下,根据需要选择使用脚本1或2. 脚本1:依次计算文件夹下面的所有gjf文件: set ...
个人分类: Gaussian|3162 次阅读|没有评论
Gaussian优化振荡的解决方案
热度 1 丁迅雷 2014-2-19 22:18
对于优化振荡的解决方案: 经过对某个体系的实际测试,发现如下解决方案: 在opt关键词中,加入Cartesian, GDIIS, NoTrustUpdate中的任何一个,均“可能”解决优化问题。 其中NoTrustUpdate有时需要结合maxstep使用,maxstep=1一般太小了,可设为10或20,其默认值是30。 其它参数如Newton或rcfc有时会加速,有时会使优 ...
个人分类: Gaussian|3968 次阅读|2 个评论 热度 1
Gaussian 输入不当导致产生Bq原子
热度 1 丁迅雷 2013-2-26 13:44
Title那一行下面空了2行,结果文件里面就会在(0.0,0.0,0.0)处多出一个Bq原子来,并造成体系对称性变为C1。 例子:输入文件如下: #b3lyp/6-31G TitleCardRequired (空行) (空行) 01 O0.00.00.0 H&n ...
个人分类: Gaussian|3973 次阅读|2 个评论 热度 1
Gaussian以后做AIM和NBO分析需要的wfn文件和.47文件
丁迅雷 2012-12-1 10:52
谢谢天外来客的指点。 -----------------------------以下输入用来做AIM2000的计算需要的wfn文件 #b3lyp/tzvp geom=allcheck guess=read output=wfn H2O.wfn ----------------------------- -----------------------------以下输入用来做GenNBO的计算需要的.47文件 #b3lyp/tzvp geom=allchec ...
个人分类: Gaussian|8330 次阅读|没有评论
Inaccurate quadrature in CalDSu 错误解决方法
丁迅雷 2012-7-4 16:27
Inaccurate quadrature in CalDSu 错误解决方法 g09/g03 输出文件最后几行大致如下: Spurious integrated density or basis function: NE= 149 NElCor= 0 El error=2.83D-03 rel=1.89D-05 Tolerance=1.00D-03 Shell 67 absolute error=2.30D-02 Tolerance=1.20D-02 Shell 67 signed error=2.30D-02 Toleran ...
个人分类: Gaussian|12541 次阅读|没有评论
使用Gaussian的log文件和RRKM理论计算速率常数
热度 2 丁迅雷 2012-6-12 09:47
rrmk.in 和rrkm2.in是两个输入文件,分别用于计算下列两种情况: 1. 两分子碰撞得到中间体,经过渡态得到产物。 通过分子的质量和相对速度计算碰撞能,并考虑温度对初始能量的贡献。 2. 已知中间体和反应的初始能量,经过渡态得到产物。 手工设置初始能量,程序计算中不考虑温度。 ...
个人分类: Gaussian|17049 次阅读|7 个评论 热度 2
GaussView画MO,density时的成键问题
热度 4 丁迅雷 2011-12-15 15:22
GaussView打开fchk文件,画分子轨道MO,density等时,有时显示的成键方式不是我们想要的, 比如有两个原子间不应该成键的,但是显示却是成键。 如果这时用Gview改一下原子间的成键情况,又会导致轨道等画不出来了(按钮为灰色)。 下面的程序是将fchk文件转化一下,修改其中的connectivity信息,得到合理的成键方式。 ( ...
个人分类: Gaussian|6458 次阅读|5 个评论 热度 4

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