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蛋白质学科常用工具总结 V1.0

已有 3494 次阅读 2013-10-21 17:29 |系统分类:科研笔记| 蛋白质, 常用工具

Motif predition

ScanProsite

(http://prosite.expasy.org/scanprosite/)

 

Secondary structure prediction and modeling

Phyre2

(http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index)

 

PSIPRED

(http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred/)

 

Domain analysis

SMART

(http://smart.embl-heidelberg.de/)

 

ELM

(http://elm.eu.org/search/)

 

Pfam

(http://pfam.sanger.ac.uk/)

 

Domain Architecture Retrieval Tool

(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/lexington/lexington.cgi)

 

Subcellular localization

PSORT

(http://psort.hgc.jp/)

 

Protein struture alignment

Dali Sever

(http://ekhidna.biocenter.helsinki.fi/dali_server/)

 

Genome Database

Candida

(http://www.candidagenome.org/)

 

Saccharomyces

(http://www.yeastgenome.org/)

 

 

Other

ESPripts 2.2

(http://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/)


2013.10.21



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