科学网—raindyok的留言板

IP: 113.140.84.* [8]陈伟飞 2014-4-23 20:04

高老师求更新

IP: 220.249.99.* [7]明家琪 2014-4-3 08:41

向高老师致敬！！

IP: 61.154.0.* [6]徐建堂 2013-10-2 13:18

小高，很高兴能够在这里看到你，特别是你的很多生物学软件，向你学习了。

我的回复(2013-10-2 14:42)：

一起学习

IP: 59.61.166.* [5]gaosanji 2013-10-1 21:49

高老师：您好！我现利用DNASP软件分析不同病毒株系群体间的“Gene Flow and Genetic Differentiation”，拟得出我要的Ks*、Z、Snn指标，但是分析结果没有Snn统计指标，不知为何。恳望您拨冗指导！非常感谢！

我的回复(2013-10-2 12:10)：高老师：您好！我已经将操作截图发给您了，请查收邮件，祝顺！

IP: 125.77.227.* [4]黄兆斌 2013-9-28 13:25

高老师，我在PhyML 3.0软件里没有找到我选择的TVMef+I+G进化模型，这个PhyML如何设置模型呢？

我的回复(2013-9-28 15:38)：可以参考百度文库《用PhyML构建系统发育树》http://wenku.baidu.com/view/e3cf0626453610661ed9f4f3.html

IP: 125.77.227.* [3]黄兆斌 2013-9-28 10:20

高老师，您好！我想向您请教个问题：我用jmodeltest选择好模型后（TVMef+I+G），用什么软件可以比较快的做ML进化分析呢，还要结合我选择的模型？

我的回复(2013-9-28 11:45)：如果确定用ML法，比较快的首推 PHYML这款软件。

IP: 202.118.20.* [2]马月萍 2013-9-12 16:22

高老师，能不能帮忙给建一下树，大约12个种，70多条序列，一直很纠结，不知适合建哪种树，构建的MP树序列比较乱，一个物种的基因会分布在不同的地方，不知该怎么分析，不知是否可以得到你的帮助，

我的回复(2013-9-12 20:58)：OK，将待建树的序列以fasta格式发我邮箱吧！最好能介绍这些序列的背景，如序列特征、同源性等，这样便于针对性优化参数，E-mail: raindyok@126.com or raindy@fafu.edu.cn

IP: 77.72.197.* [1]Michael0000 2013-6-14 15:50

有问题请教，如何联系到你？想了解你的博文《【持续更新】系统发育分析 FAQ 》下面没写的内容。
我的QQ：316513622. 邮箱 shilg.hu@gmail.com. 如有草稿，可否通知我阅览，非常感谢！

我的回复(2013-6-14 17:53)：

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