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  • 福建农林大学,副研究员

    • 生命科学->遗传学与生物信息学->生物信息学

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denglei157 2019-3-18 17:27
高老师,您好!我用modlefinder计算了核苷酸替换率,还有AIC的一些值;现在准备根据得到的结果用MrBayes构建系统进化树,请问怎么把modlefinder得到的那些值运用到建树过程中呢?根据网上的操作好像基本上都没有用modlefinder计算出来的值。我也在网上搜了一些方法,还是不太明白,十分希望您能帮我解答!谢谢!
JoeyZhu 2018-11-13 20:59
高老师您好!想向您咨询下DanSP软件是怎么才能进行Ks、Kst、Z、Snn检验分析的呢?我拜读了您的 Genetic diversity and molecular evolution of arabis mosaic virus based on the CP gene sequence 这篇文章,对这里这几个数据很感兴趣,想知道是怎么来的,但是自己用DnaSP做了很久都没搞出来是怎么做的。
十分希望您能帮我解答!谢谢!
blusmot 2016-9-22 10:30
高老师,您好,想请教您两个问题:
1. Structure 软件做遗传结构分析时,如果群体不满足(the loci are at Hardy-Weinberg equilibrium, and linkage equilibrium),那么是不是无法用该软件做分析??或者是对数据进行矫正后可以进行分析?
2. Fst values 的分析(比如不同品系间的Fst 两两比较),是不是需要首先满足数据的Hardy-Weinberg equilibrium, and linkage equilibrium,否则无法进行分析?
期待您的回答,十分感谢!
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