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- denglei157
- 高老师，您好！我用modlefinder计算了核苷酸替换率，还有AIC的一些值；现在准备根据得到的结果用MrBayes构建系统进化树，请问怎么把modlefinder得到的那些值运用到建树过程中呢？根据网上的操作好像基本上都没有用modlefinder计算出来的值。我也在网上搜了一些方法，还是不太明白，十分希望您能帮我解答！谢谢！
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- JoeyZhu
- 高老师您好！想向您咨询下DanSP软件是怎么才能进行Ks、Kst、Z、Snn检验分析的呢？我拜读了您的 Genetic diversity and molecular evolution of arabis mosaic virus based on the CP gene sequence 这篇文章，对这里这几个数据很感兴趣，想知道是怎么来的，但是自己用DnaSP做了很久都没搞出来是怎么做的。
十分希望您能帮我解答！谢谢！
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- blusmot
- 高老师，您好，想请教您两个问题：
1. Structure 软件做遗传结构分析时，如果群体不满足（the loci are at Hardy-Weinberg equilibrium, and linkage equilibrium），那么是不是无法用该软件做分析？？或者是对数据进行矫正后可以进行分析？
2. Fst values 的分析（比如不同品系间的Fst 两两比较），是不是需要首先满足数据的Hardy-Weinberg equilibrium, and linkage equilibrium，否则无法进行分析？
期待您的回答，十分感谢！
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- Raindy 注： 本文首发于本人QQ空间日志（https://user.qzone.qq.com/58001704/blog/1502418934），将不 定期更新，希望对初学者有帮助，欢迎关注。如需 ...
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