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深圳华大并购美国Complete genome公司
2012-9-18 13:07
华大的国际化又走出了一步,哪就是以一亿一千七百六十万美元购并美国Complete genome公司。Complete genome公司的主要业务是测序服务,不过与华大通过购买illumina等公司测序仪达到测序能力不同的是,Complete Genome公司主要通过自己研发的测序仪完成对客户的测序。Complete Genome公司今年二季度股票净亏损18万美元,预示 ...
个人分类: next-generation-sequence|6461 次阅读|没有评论
SplazerS-我期望中SV分析的补充方法
热度 1 2012-1-17 10:28
今天阅读文献的时候发现了用于SV检测的新软件-SplazerS,一中splicing alignment based的SV检测方法,这种方法通过把高通量测序序列与参考序列做splicing mapping,发现插入/缺失的断点位置,达到发现SV的目的。之前,很多sV分析软件主要同计算双定位到参考序列上的末端序列的定位位置之间的距离与建库的插入长度的差异来分 ...
个人分类: next-generation-sequence|8414 次阅读|1 个评论 热度 1
基于石墨单分子层纳米孔的测序技术
2010-6-3 00:33
我们知道,组成DNA序列的4种碱基有着不同的带电性质,如果能直接一一测量DNA链上每一碱基的带电性质,哪也就可以知道了DNA的序列了。一个很好的办法就是,用一块很薄的材料,然后在上面开一个很小的孔,测量通过小孔的电流(这个电流是恒定的),然后再测量当一个一段DNA序列通过这个小孔时的电流变化情况,通过电流的变化 ...
个人分类: next-generation-sequence|6058 次阅读|2 个评论
re-sequence需要多高的覆盖度
2010-5-6 18:55
今天听报告,里面有一个内容就是通过re-sequence的方法来找到相关性状的候选基因。连续到这一段时间以来,发现有很多关于重测序利用的报道,不由的想到了这个问题,那就是: 要达到我们的目的,re-sequence需要达到多大的覆盖度? 初步思考,认为与下面的内容相关: (1)物种基因组结构的复杂程度,比如说像油菜这一 ...
个人分类: next-generation-sequence|7350 次阅读|没有评论

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