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热搜: 科学 论文
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于淼 2016-1-3 00:10
《三体》中最让人回味的就是黑暗森林理论,大致意思就是文明之间并不互容,一旦暴露就会像虫子一样被碾压。如果看过科幻不多,基本就会感觉这确实是存在且令人恐惧的。那么看的多呢?应该也不会否认这是一部优秀作品。首先《三体》写的很好,但一旦好的东西变成流行就会出现些有意思的现象,例如现在很火的知识向脱口秀《 ...
个人分类: 科搜研手册|1538 次阅读|没有评论
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于淼 2016-1-3 00:09
数据库里每一个条目会有若干属性,有些属性例如性别,年龄是可重复的,有些则一般不重复,但一定会有一列是特定的,绝对不与其它条目重复。这样的属性有的是用ID表示,有的则直接根据后面的信息通过一个哈希表加密成一列数字,当然前提是别出现碰库。人也是如此,社会系统识别某一个人时往往不会用姓名,而选用身份证号之 ...
个人分类: 科搜研手册|1383 次阅读|没有评论
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于淼 2016-1-3 00:07
小学时学校里会发一种期刊,里面会有“神童”级小学生去推荐暑期读物,排第一的我化成温室气体也忘不了:《新华字典》。当时我就震惊了,随即陷入深深的自卑:同样开本的书我读的完的只有海南摄影美术出版社的《叮噹》,而且后来才知道人家还没得到版权。说到底除了小学似乎也很少去翻字典了,其实字典挺有意思的,但不是 ...
个人分类: 科搜研手册|1334 次阅读|没有评论
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热度 1 于淼 2015-10-11 14:49
木是树的旧称,甲骨文里会写成类似一个星号,上半部分代表枝叶,下半部分代表根。在下半部分加入一横就是本,根本同源;在上半部分加入一横就是末,代表枝叶末梢。所谓本末倒置大致来源于此,而这一横并非象形而是指代,代表就是这里。 进化上也喜欢用树木状结构,但跟真实的树木结构不同的在于进化上只用了树的 ...
个人分类: 科搜研手册|2113 次阅读|1 个评论 热度 1
分享 理解基因组数据分析之结果注释与通路分析篇
热度 1 于淼 2015-8-31 22:09
上面三篇费了半天口舌的最终目的就是找出靠谱的差异基因,但到这里只算是研究的开始,下一步我们要为这些差异基因寻找意义。 分子生物学的研究方法一般就是围着中心法则转圈并找出同一层次的上下游变化。举例而言,如果我们实际发现一个突变性状想找到调控基因,那么你最好能纯化出这个蛋白或者根据相似性原理找一组同 ...
个人分类: 科搜研手册|5503 次阅读|2 个评论 热度 1
分享 理解基因组数据分析之建模与可视化篇
热度 1 于淼 2015-8-30 13:58
原始数据导入时我们所遇到的背景问题说到底是测定的系统误差,期望可以看作0。但有些影响是我们不希望看到但依旧存在的,例如你测定了100多份基于地区分布的人体样本中的感兴趣基因组,但由于采样原因不可能同时采集,而时间的差异会直接导致诸如温度等影响了样本的均质性,这种情况下进行统计推断就需要平衡掉这些因素的 ...
个人分类: 科搜研手册|5226 次阅读|6 个评论 热度 1
分享 理解基因组数据分析之差异比较篇
于淼 2015-8-29 11:14
先从最简单的例子来,假设我们比较两组人的平均身高该如何做?我们要对两组人采样,采样数最好一样,然后测量每个样本的身高,记录后分组计算均值与方差。如果目的是比较均值,那么首先要考虑使用的方法,如果是t检验,那么先对均值的方差进行F检验来确定是否需要等方差t检验,然后就是双样本t检验,结果显著(p0.05) ...
个人分类: 科搜研手册|6416 次阅读|没有评论
分享 理解基因组数据分析之数据读取与数据结构篇
于淼 2015-8-28 09:43
这一系列的文章源于edx上PH525这一系列 (https://www.edx.org/course/statistics-r-life-sciences-harvardx-ph525-1x),从实用角度出发分为四部分: - 原始数据读取与数据结构 - 高维数据的分组差异比较 - 基因组数据建模与可视化 - 结果注释与通路分析 其实就是按工作流程走的,首先设计实验,跑芯片,然后拿到机器 ...
个人分类: 科搜研手册|3220 次阅读|没有评论

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