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热搜: 科学 论文
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[2011-08-03][Bifurcations and Oscillations][Learn Python]
吴诚堃 2011-8-4 01:52
[2011-08-03][Bifurcations and Oscillations][Learn Python]
一、Bifurcations and Oscillations. 1. 什么是 "Bifurcations"? 定性描述系统动力学状态随参数发生的变化。 2. Phase Line diagram 对于类似y'=f(y)的系统,用一个轴表示y的变化。在该轴上,可能会有sink,source或者node. Sink表示吸引附近的解的定点。source表示排斥附近解的定点。既不是si ...
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[2011-07-27][关于POMC的事实与假设]
吴诚堃 2011-7-27 07:45
事实: 1. 在外加CRH刺激的时候,POMC并没有像ACTH一样发生剧烈的变化。 2. POMC的half life要比ACTH长得多 3. POMC的Pulsatility没有ACTH那么明显。 4. POMC一样显示出circadian rhythm. 假设: 1. 作为对acute stress的响应时,CRH主要影响的是ACTH的释放而不是转录和翻译的过程。这是因为需要迅速做出应激 ...
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[2011-07-25][Nonlinear systems and Linearization]
吴诚堃 2011-7-26 06:06
今天继续在看什么情况下动态系统会产生持续震荡。 对于非线性系统,第一步往往是进行线性化(Linearization)。关于这一步,网络上的一个材料很不错( http://math.rwinters.com/S21b/supplements/nonlinear2005.pdf )。深入浅出,易懂好学。 第二步就是对线性化后得到的线性系统进行分析,利用Hopf Bifurcation产生的 ...
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[2011-07-23][XPPAUT]
热度 2 吴诚堃 2011-7-24 08:06
Pedro给我推荐了一个研究动态系统时很有用的软件 XPPAUT 。 这个软件功能还是很强大的,我觉得唯一的缺憾可能是GUI比较差,生成的图形也不是那么美观。一种变通的方法是解析XPPAUT的输出文件,用MATLAB来生成相应的图形。 XPPAUT有在线文档,也附带了很多例子。同时在下述一书的附录B是该软件作者写的关于使用XPPAUT ...
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[2011-07-20][Condor | oscillations]
吴诚堃 2011-7-21 03:56
今天去听了学校RCS(Research Computing Service)搞的Condor培训课程。UoM里Condor好像应用还蛮广泛的。Condor系统的大致思想就是把学校里开着的闲置机器的CPU时间利用起来。Condor系统非常适合那些需要得到不同参数组合情况下的结果的程序。既不用花力气修改程序,也不用管并行的事情。UoM的Condor可以运行C程序、Java程序 ...
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[2011-07-18][Sustained Oscillations of Goodwin's Model]
吴诚堃 2011-7-19 06:48
今日试图用COPASI、Matlab重现Goodwin的论文中非保守系统(non-conservative system)出现持续震荡(sustained oscillations)的结果,根据文章中提供的参数,我变换了很多初始值都无法得到文中Fig.13的结果。后来在Didier Gonze题为"Design principles of biological oscillators"的幻灯片中看到要想在Goodwin模型中出现这种持 ...
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[2011-07-16]
吴诚堃 2011-7-17 06:46
今天在阅读1965年B C Goodwin发表的一篇论文“Oscillatory behavior in enzymatic control processes”。读到一半突然想看看除了Matlab和Mathematica之外有没有别的软件可以做动态系统的建模和模拟。发现了两个: 1. Berkely Madonna ( http://www.berkeleymadonna.com/ ) 这个名字拉风的软件号称自己是速 ...
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家书抵万金
吴诚堃 2010-12-26 02:12
西方的圣诞节是合家团圆的日子,正如中国的春节。平安夜的大餐,让我无比想念年三十的团圆饭。 远方的家人,远方的朋友们,你们都还好吗?我发出的祝福,你们收到了吗?
个人分类: 留学点滴|2296 次阅读|没有评论
曼彻斯特街头的Jingle Bell
吴诚堃 2010-12-24 08:11
西方传统的圣诞节马上就要到来,节日的气氛越来越浓厚。随处可见红帽子,打折广告,满载而归的购物者。今日被曼城街头的这个乐队表演给吸引住了。
个人分类: 留学点滴|2732 次阅读|没有评论
AstraZeneca一日游
吴诚堃 2010-12-24 08:08
12月22日来到位于英格兰西北部小镇Alderley Edge的世界著名的制药公司AstraZeneca(阿斯利康,参见 http://health.sohu.com/s2005/5393/s226395206.shtml )参观学习。这个公司总部在伦敦,在Alderley Edge的这个Alderley Park是AstraZeneca全球最大的研发中心,有约3000名研发人员。去年他们用于研发的资金超过1 ...
个人分类: 留学点滴|4067 次阅读|没有评论

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