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分享 GPCR phylogenetics tree
热度 1 袁曙光 2011-7-29 17:52
GPCR phylogenetics tree
5391 次阅读|1 个评论 热度 1
分享 [转载]ssh超时断开的解决方法
袁曙光 2011-7-22 13:07
当用SSH Secure Shell连接Linux时,如果几分钟没有任何操作,连接就会断开。必须重新登陆才行,每次都重复相同的操作,很是烦人,一般修改两个地方可将这烦人的问题解决 1、echo $TMOUT 如果显示空白,表示没有设置, 等于使用默认值0, 一般情况下应该是不超时. ...
个人分类: 好文转载|2354 次阅读|没有评论
分享 Science Arts 2
袁曙光 2011-7-19 04:02
Science Arts 2
DNA Binds to Protein ABT-737 Binds to Bcl-XL Antagonist Binds to GPCR
个人分类: 科研笔记|2857 次阅读|没有评论
分享 Desmond Configuration in Cluster
袁曙光 2011-7-16 13:17
Configure the schrodinger.hosts in /home/user/.schrodinger folder 1. with multiple nodes in the same host name: 32a host: myhost queue: PBS qargs:&n ...
个人分类: 科研笔记|2824 次阅读|没有评论
分享 [转载]PBS作业调度应用与说明
热度 2 袁曙光 2011-7-15 01:35
PBS(Portable Batch System)最初由NASA的Ames研究中心开发,主要为了提供一个能满足异构计算网络需要的软件包,用于灵活的批处理,特别是满足高性能计算的需 要,如集群系统、超级计算机和大规模并行系统。PBS的主要特点有:代码开放,免费获取;支持批处理、交互式作业和串行、多种并行作业,如MPI、 PVM、HPF、MPL ...
个人分类: 好文转载|18587 次阅读|2 个评论 热度 2
分享 [转载]Linux下实现自动设置SSH代理
袁曙光 2011-7-4 01:32
SSH的巨大价值体现在能够配置为代理服务器上。不像在Windows下每次还需要手动登录设置,Linux有很好的工具链能够实现自动设置SSH代理,就是expect和ssh的联合使用,再加上proxychains,任何程序都可以享用代理了,在此我简单介绍一下。 首先要安装expect和openssh, 接下来需要写一段脚本: #!/usr/bin/expect set ...
个人分类: Linux相关|4142 次阅读|没有评论
分享 [转载]Release Notes of Desmond 3.0
袁曙光 2011-6-30 03:27
The Desmond development team is pleased to announce a new release of the Desmond molecular dynamics system. As with earlier releases we offer two versions of the Desmond software: a combined Desmond / Maestro binary package corresponding to Schrödinger’s recent Suite 2011 and a ...
个人分类: 好文转载|2673 次阅读|没有评论
分享 Membrane Protein Simulation with Desmond
热度 1 袁曙光 2011-6-25 02:59
Membrane Protein Simulation with Desmond
Desmond supports algorithms typically used to perform fast and accurate molecular dynamics. Long-range electrostatic energy and forces can be calculated using particle-mesh-based Ewald techniques.Constraints can be enforced using the M-SHAKE algorithm. These approaches can be used in combination w ...
个人分类: 科研笔记|5859 次阅读|1 个评论 热度 1
分享 [转载]Cell free protein expression
袁曙光 2011-5-27 13:32
Cell-free protein array From Wikipedia, the free encyclopedia Cell-free protein array technology produces protein microarrays by performing in vitro synthesis of the target proteins from their DNA templates. This method of synthesizing protein microarr ...
个人分类: 好文转载|5058 次阅读|没有评论
分享 humor at conference
热度 2 袁曙光 2011-5-24 21:22
Recently, I am attendinga conference in Utrecht, Netherlands. Some speakers (PhD student)made mistakes during the presentation. Although scientists are quit serious for most cases, they still have humors: 1. one speaker madespellingmistakes for his institut ...
个人分类: 科研笔记|2012 次阅读|6 个评论 热度 2

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