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分享 [转载]很喜欢的一张图:根瘤菌全家福
陈文峰 2018-11-6 17:25
根瘤菌全家福,选自 Tak A. , Gehlot P. , Pathak R. , Singh S. K.编著的《 Rhizobium Biology and Biotechnology》(《根瘤菌生物学与生物技术》)一书第22页,2017年出版。是基于16S rRNA基因绘制的系统发育树状图。 清晰的矢量版的可以这里下 ...
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分享 文新中慢生根瘤菌(Mesorhizobium wenxiniae)
陈文峰 2018-4-27 10:36
张俊杰博士等人最近(2018年4月)在国际系统与进化微生物学杂志(IJSEM)上发表一个分离自鹰嘴豆(chickpea, Cicer arietinum L.)的根瘤菌新物种,定名为:文新中慢生根瘤菌( Mesorhizobium wenxiniae ),种名来自陈文新先生的名字的拉丁化,以表示对陈先生的尊重( to honour Wen-xin Chen, a respected soil m ...
个人分类: 根瘤菌分类|1972 次阅读|没有评论
分享 根瘤菌科新属:Pararhizobium gen. nov.
陈文峰 2015-4-2 10:16
继2014年提出的新属 Neorhizobium 之后( http://blog.sciencenet.cn/blog-3533-785544.html ),芬兰的Mousavi等人再次提出一个新的属: Pararhizobium gen. nov.,发表于2015年的SAM杂志上: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S072320201400191X# Revised phylogeny of Rhizobiaceae : Prop ...
个人分类: 根瘤菌分类|10341 次阅读|没有评论
分享 [转载]收藏:世界上一些菌种保藏库的名称缩写及全称
陈文峰 2014-12-4 17:04
世界上一些菌种保藏库的名称缩写及全称:原文见 :http://jcm.brc.riken.jp/en/abbr_e 也可参考LPSN网站收录的清单: http://www.bacterio.net/-collections.html ABB Asian Bacterial Bank, Samsung Biomedical Research Institute, Seoul, Republic of Korea. ACAM Australian Collection of Ant ...
个人分类: 根瘤菌分类|14166 次阅读|没有评论
分享 推荐一篇根瘤菌多样性与豆科植物共生关系的一篇论文
热度 1 陈文峰 2014-11-6 08:57
Peix等人最近在Critical Reviews in Plant Sciences杂志上发表了一篇论文,题目是:Bacterial associations with legumes,系统地阐述了根瘤菌的多样性及与豆科植物关系的论文,这里推荐一下。本文对分离自豆科植物根瘤的细菌,包括固氮根瘤菌和非固氮根瘤菌的新种进行了系统而全面的收录,特别是没有被收录到LPSN网站( ...
个人分类: 根瘤菌分类|10423 次阅读|1 个评论 热度 1
分享 用R语言统计一下LPSN网站上的各属内的物种数
陈文峰 2014-4-20 22:19
#使用R语言,可以将LPSN网站( http://www.bacterio.net )上的感兴趣的细菌的属下的物种数统计出来并做图: library(stringr) #统计中华根瘤菌属( Sinorhizobium ) SinorhizobiumPage - readLines(http://www.bacterio.net/sinorhizobium.html) grep('Number of species', SinorhizobiumPage ...
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分享 根瘤菌类群的一个新属:Neorhizobium gen. nov.
陈文峰 2014-4-16 16:17
芬兰的Mousavi等人新近提出了一新的属, Neorhizobium gen. nov.,它是将之前发表的几个新种合并到一起,并提出新的属,属名命名为新根瘤菌属( Neorhizobium )。详见这里: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0723202014000204 Abstract The genera Agrobacterium , Allorhizobium , and Rhiz ...
个人分类: 根瘤菌分类|7908 次阅读|没有评论
分享 B. japonicum USDA 110改叫Bradyrhizobium diazoefficiens
陈文峰 2013-7-19 07:13
Bradyrhizobium japonicum USDA 110是广泛应用的大豆高效根瘤菌菌株,但由于它与Bradyrhizobium japonicum的模式株USDA6T并不一样,不是同样的种,因此,它的分类地位一直处于模糊状态。近来,巴西科学家Mariangela Hungria课题组将USDA 110及相关菌株进行了分类学研究,确定USDA 110为不同于已知种的新种,将其命名为:高 ...
个人分类: 根瘤菌分类|5708 次阅读|没有评论
分享 根瘤菌的表型测试以后还需要不需要做?
陈文峰 2013-5-22 21:32
根瘤菌的表型测定,包括对各种碳源、氮源的利用、抗生素抗性、对染料的利用或抗性,对盐、碱的耐受性等 。表型测定曾在根瘤菌数值分类和新种描述中起着重要作用,至今仍是新种描述的必需指标 。由于表型测定的工作繁琐,有时受影响条件较多,重复性不是很好,与基因型研究的结果不一致等,因此,随着根瘤菌基因组测序 ...
个人分类: 根瘤菌分类|2445 次阅读|没有评论
分享 仍有很多的人在用Sinorhizobium,很少人在用Ensifer
热度 1 陈文峰 2013-3-14 21:07
自2003年Young J.M.提出将 Ensifer 和 Sinorhizobium 合并,并认为Ensifer先发表,因此 Ensifer 应该优先使用以来,已过去了十个年头(见我的另外一个博客评述: http://blog.sciencenet.cn/blog-3533-496339.html )。至今的情况如何了呢?英国York 大学的Peter Young(与上面的Young J.M.不是一个人,也不是一个道上的)日 ...
个人分类: 根瘤菌分类|2968 次阅读|1 个评论 热度 1

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