独轮车上的博导分享 http://blog.sciencenet.cn/u/yanjx45 狂犬病、流感、结核病和人类遗传学科普园地。 提供根治 “狂犬病恐惧症” 的灵丹妙药。 奉献在中国彻底消除狂犬病的锦囊妙计。

博文

经典狂犬病毒的分子流行病学(二)

已有 1657 次阅读 2021-9-16 14:14 |个人分类:狂犬病防治|系统分类:科普集锦

经典狂犬病的分子流行病学(二)

全球分布世系(Cosmopolitan lineage)-(2)

——大型学术专著《狂犬病(Rabies)》最新版选译

 

5章 分子流行病学(Molecular epidemiology)

作者:Susan A. Nadin-Davis

加拿大渥太华:加拿大食品检验署,渥太华Fallowfield实验室。

Canadian Food Inspection Agency, Ottawa Laboratory- Fallowfield, Ottawa, ON, Canada)

5.狂犬病毒的分类Lyssavirus taxonomy

5.4.1 丽沙病毒属的物种(Lyssavirus species)

5.4.2 狂犬病相关丽沙病毒(lyssaviruses)的分子流行病学

5.4.3. 经典狂犬病毒(RABV)的分子流行病学(一)

全球分布世系(Cosmopolitan lineage)-(1)

5.4.3. 经典狂犬病毒(RABV)的分子流行病学(二)

全球分布世系(Cosmopolitan lineage)-(2)

除了少数研究外,中东地区的狂犬病状况普遍缺乏记录,这是对狂犬病长期疏忽的传统和一些地区持续的社会冲突的结果。

image.png 

5.2 (接前图) (BD) 这些显示了相同的NJ树,由200个RABV的N基因生成,不同的分支clades在每张图中折叠排列,以显示每个世系的细节,如相关文本所述。每个样品通过其名称和NCBI登录号进行识别。大多数主要节点的自举支持度(Bootstrap support以百分比表示,根据每张图底部的比例,分支长度表示遗传距离。以ABLV分离株的N基因为外群outgroup)对照

 (B) 全球分布世系的细节。

image.png 

5.2 (接前图) (C)非洲2Africa 2非洲3Africa 3北极/北极样Arctic/Arctic-like亚洲和印度次大陆 Asian and Indian subcontinent世系的细节;()

 

被称为中东变种Middle-Eastern variant的病毒与欧洲流行的病毒关系密切,在几个国家传播,并被分为四种不同的类型,表现出复杂的区域传播模式。其中之一似乎主要局限于土耳其;在这里发现的变种与欧洲其他地区的变种有明显区别,可能是由于这些国家与巴尔干半岛其他国家被巴尔干山脉分隔开,山脉可能成为疾病传播的重要屏障。在土耳其西部和东部地区流行的两种不同的病毒类型主要是由狗传播的,尽管在土耳其西部地区已经发现了与狐狸相关的病毒,这可能代表了该病毒的宿主转移。

尽管在在以色列的北部对狂犬病的控制工作一直在努力进行,当地的野狗和狐狸仍是中东几种类型的变种的储存宿主,这是由于狗携带的在系统发生上与土耳其分离株密切相关的变种的入侵。

约旦、伊朗、伊拉克等家和高加索中部平原地区,包括阿塞拜疆格鲁吉亚,同时流行着多个变种(见CA2和CA3),而最近出现的一种独特变种在阿拉伯半岛的大部分地区传播。虽然中东变种病毒已经传播到远达伊朗东部边界,但再往东的病毒通常以北极样类Arctic-like group为代表;事实上,在伊朗东部边境地区只发现了两种北极病毒经度60度对应的区域似乎清楚地划分这两个世系

亚洲,全球分布世系的草原狐病毒steppe fox virus 向东传播至俄蒙边境,并进入蒙古、内蒙古和中国西北省份。虽然中国的大多数狂犬病病例是由不同的亚洲世系造成的,但在中国其他几个省份也有关于犬类的全球分布世系的报道,目前尚不清楚这些病例是历史上从其他国家引入的结果,还是使用未灭活兽用疫苗的后果。

相关博文:

狂犬病毒的分子流行病学(1) 2020-08-12

狂犬病毒的分子流行病学(2) 2020-08-13

狂犬病毒的分子流行病学(3) 2020-08-17

  狂犬病毒的分子流行病学(4)   2020-08-22

狂犬病毒的分子流行病学(5)   2020-08-27

狂犬病毒的分子流行病学(6)   2020-08-28

狂犬病毒的分类  2020-9-1  

 澳大利亚蝙蝠丽沙病毒(ABLV) 2021-09-07  

  欧洲蝙蝠丽沙病毒(EBLV) 2021-09-08

  亚洲蝙蝠丽沙病毒 2021-09-10

     非洲的丽沙病毒 2021-09-12  

经典狂犬病毒的分子流行病学(一) 2021-09-15

权威的大型学术专著《狂犬病(Rabies)》最新版已面世   2020-06-29

犬狂犬病毒的起源和家谱(分子钟证据) 2012-6-18 

多国合作科研项目:全球犬狂犬病病毒的起源和系统进化研究  2012-6-19

中国狂犬病病毒变种的历史评估和进化分析  2012-6-19 



http://blog.sciencenet.cn/blog-347754-1304455.html

上一篇:经典狂犬病毒的分子流行病学(一)
下一篇:经典狂犬病毒的分子流行病学(三)

1 伍赛特

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2021-11-28 23:12

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部