适合大规模数据显示的幻灯片制作工具：Prezi

热度 2 周旭 2012-6-22 14:14

生物数理模型往往涉及到大规模的数据显示，比如全基因组变异功能分析，全RNA基因表达组分析等等。 我们往往需要及显示数据的全貌，又能够放大显示其中的细节。Prezi是这一领域非常酷的一款工具。具体可以看看我制作的一个例子： http://prezi.com/moyigbdaqzve/bcdiff_1812x65_quantilenorm_filterallcolumepless ...

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看看物理学家是如何研究癌症的

热度 4 周旭 2012-6-22 14:05

对研究物理学的人来说，Santa Barbara 的KIPT无疑是理论物理学家都向往朝圣的麦加圣地。这里每年都会举行十来场 物理领域的前沿讨论会，时间长达2到3个月。其目的是希望给研究者一个充分交流和思想碰撞的机会。现在的主题是“癌症和癌症的数理模型”，大部分的录像和幻灯片都是开源的。对于不能参加而又对癌症和癌症的数理 ...

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Theory Lunch: 癌细胞的干细胞与非干细胞转化模型

热度 1 周旭 2012-4-16 14:05

Cancer stem cell hypothesis triggered a bigenthusiasm for developing drugs specially targetingCancer stem cell. There are even several bioTech companies which specialized on drugs on Cancer stem cell. Unfortunately, Weinberg's group find that non-stem cancer cell can&n ...

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2012年的物理学.癌症KITP研讨会

周旭 2011-10-3 13:37

KITP是一个很有意思的地方，理论物理，实验物理，数学，生物研究者都在这里汇集，观点交锋，灵感迸发。明年有一个物理学.癌症KITP研讨会，值得一去。 Physics and Mathematics of Cancer Coordinators: RobijnBruinsma, Jean-FrancoisJoanny, ArnoldLevine, FuyuTaman ...

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2011年的系统生物学会议

热度 1 周旭 2011-5-1 03:55

在最近的Cell杂志中有一期关于系统生物学的综述。系统生物学目前的确还没有一个明确的定义。 Adam Arkin的文章中将系统生物学定义为以下三个方面： × 关于基因组、蛋白质组、新陈代谢组，以及表观基因组的高通量数据，与生物功能、疾病、发育和进化等的关联分析。这样的研究得到的往往不是因果性的结论，因此需要通 ...

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科学让哲学走开？

热度 1 周旭 2009-9-27 05:40

Relationship among Science, Philosophy and Religion 自然科学和哲学在西方本来是不二分的。比如，Ph.D的全称就是Doctor of Philosophy。牛顿关于经典力学体系的书名就叫做《自然哲学的数学原理》。许多科学家同时也是哲学家，或者也有深 ...

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作研究需要的绣花功夫

周旭 2009-9-21 05:05

在《 射雕英雄传 》 里 , 欧阳锋与老顽童周伯通争夺九阴真经。 周伯通让郭靖背熟以后 , 故意逗欧阳锋，说如果你会一种功夫，就把九阴真经给他。欧阳锋大喜，周伯通用功力将经书化为千百碎片，迎风一吹，若蝴蝶般飞扬，然后说道：要得到九阴真经，你需要裱糊匠的功夫 ...

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论文选读： 生态网络的复杂性影响稳定性吗？

周旭 2009-9-16 00:25

Fig. 1 The more connection and species, the more unstable Recently my former group published one paper about the stability of complex food network in the journal 'Science'. This is not my direction. But I am near enough to understand their ideas of research. The basic question came from Rob ...

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谈谈有关生物物理方面的书 (2)

热度 1 周旭 2009-7-7 01:36

非线性动力系统方面的书 为什么非线性动力系统在生物物理的研究中很重要? 是因为非线性现象在生物物理普遍存在, 这是与经典物理学有所不同的地方. 在经典物理学中的牛顿第二定律, Maxwell电磁场方程和量子力学中的Schrdinger 方程都是线性方程. 而有关生命的许多物理现象往往需要用非线性方程来描述. 比 ...

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