博文
- #笔记#氨基酸残基质子化形式的判断（pKa预测）
- 1、判断aa残基的质子化形式 过程简述： a、计算pka 可以使用propka 或者H++等在线网站，在输出文件中，会列出相应残疾的pKa预测值，以及氨基酸类型； b、可视化检查。用VMD、PyMol等打开蛋白质的三维构象，看HIS侧链的ND1和NE2哪个可能和其它残基形成氢键，能形成氢键的，且H在HIS上更为合适的，就认定该N原子是质 ...
- #笔记#pymol
- User interface （UI）：Basic Settings # File- New Pymol Windows Reinitialize # Display – sequence mode – residues names Quality 整体外观的修改 Color ...
