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Biological review: 如何正确检验与解读交互作用
张霜 2024-3-11 20:21
去年,一代大刊《Biological review》上发表了题为“Understanding ‘it depends’ in ecology: a guide to hypothesising, visualising and interpreting statistical interactions的综述”(Spake et al. 2023)。专门针对交互作用进行综述,我还是第一次看到。 理论上,只要因素A对Y的影响程度或方向随着因素B的值而 ...
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时空自相关数据的处理--Science案例
张霜 2024-3-9 08:43
时间,空间自相关会影响数据的独立性,也是审稿人问无可问时,经常顺道来一嘴的问题,当然更是时常困扰我们,一句话把我们打进万丈深渊的的问题之一。上周五(2月29号),Science上发表的Divergent responses of pelagic and benthic fish body-size structure to remoteness and protection from humans这篇文章,研究了 ...
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混合模型为何能如此风靡?
张霜 2024-3-6 09:35
人在江湖,身不由己,想保持自己的所作所为不受他人影响很难。数据其实也一样,一个数据点,总会与其他数据点存在各种各样的相互关联,进而影响到其独立性。而独立性,又是数据分析的前提条件之一。所以独立性这个问题,说起来简单,事实上想把独立性这个问题完全解决了,尤其是对野外调查、观测数据而言,非常困难,有时 ...
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他们重新分析了PlosONE上一篇论文的数据,转手发了Nature!
张霜 2024-3-5 19:13
把发表在plosONE上的一篇论文的数据重新分析一遍,然后发了Nature, 这竟然不是琼瑶片。下面这篇去年的nature文章就是如此!看来搞研究,格局一定要打开啊,再也不能说PlosONE发的都是烂文章了(我自己其实也发过哈哈)。 这篇nature文章的摘要里说“Here, we reanalysed 27 years of insect biomass data from H ...
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Meta分析,再登Science!
热度 1 张霜 2024-3-4 20:09
2月2号,science上发表了题为《Functional traits—not nativeness—shape the effects of large mammalian herbivores on plant communities》的论文,论述了大型植食性动物对植物群落的影响主要取决于其功能属性。 抛开科学问题不说,这是一篇典型的Meta分析论文,通篇采用Meta分析的套路完成,值得学习。该研究也是 ...
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自然比率数据该如何分析?
张霜 2024-1-31 09:04
自然比率数据是非常常见的一种数据类型,比如叶片被虫子吃掉的比率,植被盖度等等。 这类数据的特点是值位于0,1之间,但又和由比率数据转换而来的比率数据有所区别(比如你播种了100粒种子,萌发了40个,萌发率为0.4,这就是典型的计数数据转化而来的比率数据,这种比率数据,属于典型的二项分布)。而自然比 ...
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引用达8900次的混合模型现象级论文
张霜 2024-1-24 21:44
混合模型这个统计怪兽是从什么时候开始,在生态学领域大行其道的呢?大概是2010年之后,随着Trends in Ecology and Evolution发表了这篇 Generalized linear mixed models: a practical guide for ecology and evolution 经典论文的发表,点燃了混合模型的星星之火 (Bolker et al. 2009) 。 随着nlme,尤其 ...
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统计模型的包容关系图--值得收藏
张霜 2024-1-24 21:37
最近看到了一个 University of North Dakota 的 Mark Williamson 大师做的一个题为《 Generalized Linear Mixed Models for Everything 》的报告(大家可以在众所周知的网站上找到这个视频)。光看题目就知道,这哥们儿跟我一样,也是个混合模型粉儿。这个报告十分值得大家参考的一点是把当前统计方法的包容关系做 ...
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学生联名举报导师事件折射的数据分析顽疾
张霜 2024-1-24 21:33
最近华农学生联合举报导师事件,红透全网,长达129页的举报材料看得人触目惊心、头皮发麻。在这封举报信中,导师的几大击穿科研狗底线的罪状之一就是肆意诱导学生篡改、捏造实验数据(见下图),以弄出“显著的结果”为唯一追求。因为只有这样,“论文才能被接受,学生才能毕业”。 篡改、捏造数据固然是 ...
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Nature methods:善变的P值产生不可重复的结果
张霜 2024-1-14 21:32
最近,看到2015年的Nature methods(IF高达48)上发表的一篇题为“The ficklePvalue generates irreproducible results”的泛科普论文,详细论述了为何当前很多科学结果无法重复的一个重要原因,就是P值太善变,而我们报道结果的时候,又过度依赖于P值造成的。数据显示,这篇理论性的文章自发表之后引用已达8 ...
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