Xiaowuguijinniu的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/Xiaowuguijinniu


  • 曲阜师大,生命科学学院,讲师

    • 生命科学->微生物学->生命科学

    扫一扫,分享此博客主页
你需要登录后才可以留言 登录 | 注册


yangchan 前天 13:34
您好,请教一个问题。我在用本地blast的时候,在建库的时候,出现Error: mdb_env_open: Input/output error的错误指令,请问这如何解决呢?谢谢。
查看全部
统计信息

已有 1684 人来访过

[转载]一文读懂进化树(图文详解) 2020-07-10
一、什么是进化树 系统发育进化树 ( Phylogenetic tree ):  一般也叫系统进化树,进化树。它可以利用树状分支图形来表示各物种或基因间的亲缘关系。 ...
(138)次阅读|(0)个评论
[转载]基因正选择分析 2020-07-09
一、自然选择的检测 非同义替代与同义替换的比值,即:ω 值,也就是通常所说的dN/dS(或Ka/Ks)。 (1)当ω  =1时,中性进化  ...
(159)次阅读|(0)个评论
[转载]PAML中文手册 2020-07-09
1 综述   PAML(将最大似然法用于系统发育分析)是一个用最大似然法来对DNA和蛋白质序列进行系统发育分析的软件包。 PAML 文档 除了这个手册,请 ...
(177)次阅读|(0)个评论
将比对好的fasta序列转换成relaxed phylip格式 2020-07-09
library(devtools) install("phylotools") library(phylotools) dat <- read.fasta("aligned.fasta") dat2phylip(dat, outfile&n ...
(231)次阅读|(0)个评论
[转载]利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息 2020-07-09
方法一: 标签颜色区分样品分组 利用标签的颜色来区分样品分组,不同颜色代表不同的分组。如下所示: 要实现上方进化树图中对每一个样品或基因名 ...
(109)次阅读|(0)个评论
[转载]图解核苷酸替代模型的选择 - ModelGenerator 篇(By Raindy) 2020-07-08
【絮语】   关于核苷酸替代模型的选择,本人空间已经先后介绍了MrModel、Modeltest、jModelTest等软件的使用图解, 这些软件各有优缺点。这里介绍另一款替 ...
(210)次阅读|(0)个评论
[转载]系统发育分析常见问题 2020-07-07
1.什么序列适合建树?(建树的前提) 很多同学老师都习惯性的拿到序列,直接多重比对后,顺手拿个软件就直接建树。殊不知,有些序列根本就不适合建树,构 ...
(211)次阅读|(0)个评论
[转载]多序列比对,进化树分析,保守位点分析 2020-07-07
多序列比对 Clustalw,Clustalx 与 MEGA的下载安装 Clustalw 下载链接: http://www. clustal.org/download/cu rrent/clustalw-2.1-win.msi Clustalx ...
(227)次阅读|(0)个评论

查看更多

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2020-7-12 05:14

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部