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热搜: 科学 论文
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分享 R 语言 常用的小操作 小技巧
靳泽星 2019-11-20 20:50
①head()或者tail() 用法:data-read.csv(seq.csv,row.names=1)#将文件赋值给data head(data)#查看data的前6行 tail(data)#查看data的后6行 ...
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分享 R 绘制 韦恩图(venn图)
靳泽星 2019-11-19 22:15
绘制韦恩图需要的包是VennDiagram,可以看我之前的博客安装和加载R的包的操作,绘制的Venn图样式会如下图所示。这个包只能绘制2~5样本,就是说如下图是4个圈叠加在一起,这个包绘制的Venn图只能是最少2个椭圆圈,最多5个椭圆的。 比如你有9个样本,样本1,样本2,样本3......样本9,样本1-3是低温处理, ...
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分享 R语言 包的安装
靳泽星 2019-10-15 18:05
我知道的R包的安装方法共有3种可以通过执行命令:install.packages(包的名字) 来实现包的安装,注意 不要忘记引号,命令执行后会弹出下图最右侧的CRAN镜像站点的列表,选好站点后点确定就OK了。如果没有报错的话,就安装成功了。有时会看到warning :某包是某版本建造的。这是无所谓的, ...
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分享 linux操作系统下生成一段随机的DNA序列
靳泽星 2019-10-13 09:42
本篇博文纯属个人练习,可能有一万种方法实现我要得到的这个结果,原理很简单就是利用python的random模块在1到4之间产生随机数,再将随机产生的1,2,3,4四种数字替换为A,G,C,T。首先要说明的是我使用的linux系统版本是ubuntu。 #linux命令总概(蓝色部分为命令部分) #ct:用户名 #ehbio:宿主机的名字 #~ ...
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分享 R绘制 序列分析图
靳泽星 2019-9-27 20:57
本文主要参考了微信公众号“生信宝典”的文章,链接为 https://mp.weixin.qq.com/s/I9YboydSHsuVs6hDJSy0vg 首先是数据的准备,你获得一条条的DNA序列,将这些DNA序列放入到excel表中,另存为csv文件,然后读入到R中,数据格式如下: #需要安装和载入“ggseqlogo”包 install.packages(ggseqlogo) l ...
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分享 R语言设置工作目录
靳泽星 2019-8-30 17:25
设置工作目录应该是R运行的第一步,R需要你给它指定一个文件夹以便它读取文件或者输出文件。一般设定工作目录的方法有两种。一是直接输入代码,比如: setwd('F:/Ryuyan/data') setwd命令是设定工作目录,括号中的内容便是工作目录文件夹的具体位置,上面的位置就是说R将会在c盘Ryuy ...
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分享 R语言文件的读取
靳泽星 2019-8-29 17:21
呀呀呀有点小激动呐,我不知道以何种形式展示这部分内容。暂且先胡乱写点吧。我想要传授的内容可能比较肤浅,毕竟已有刘永鑫,陈同,刘尧等及众多微信公众号我知道的大神各种精彩的展示,这样比起来,我的内容更像是如何读懂大神的代码的基础知识。 我所看到的R语言文件的读取也就是常用的文 ...
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分享 我的第一篇博客
靳泽星 2019-8-28 15:44
作为一名生物信息方面的初级选手,在不停学习和浏览各位大神的博客以及公众号等各种形式的学习内容后。深刻体会到这些学习经验分享的重要性。 由于第一次搞博客这种东西,所以先写一点东西纪念一下。希望自己在之后能够有所提升,并得到大家的认可。我个人认为自己是一个书面表达能力一般的人 ...
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