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分享 [转载]聚类分析树之间的对比
2019-9-13 11:49
昨天跑着《Numerical Ecology with R》(2018版)的代码,又出了一张很有意思的图。 这个图是用tanglegram{dendextend}画的,具体代码如下。 # Objects of class hclust must be first converted into objects of # class dendrogram class(spe.ch.ward) dend1 - as.dendrogram(spe.ch.ward) cl ...
个人分类: 数据分析|356 次阅读|没有评论
分享 [转载]用 googleVis 包画地图
2019-9-8 15:55
因为赖江山老师翻译的《数量生态学——R语言的应用》真的是看不懂,最近开始看起了英文版的 Numerical Ecology with R,这一本是2018年再版的,比上一版确实实用了太多。所以打算将一些重要的笔记记录在此。 大家可以自己去下载他的数据,或者发邮件(2674102796@qq.com)找我要。 加载包,并读取数据。 library(Rgoogl ...
个人分类: 数据分析|318 次阅读|没有评论
分享 谈下鬼伞的自溶
2019-6-10 20:08
鬼伞自溶 鬼伞,因朝生暮去而闻名!可以说是“朝菌不知晦朔”的代表种类了,可是鬼伞为何要自我溶解?这一行为又是如何演化出来的呢? 褶纹近地伞 褶纹近地伞 Parasola plicatilis 褶纹近地伞菌盖灰白,中部稍黄,下凹; ...
个人分类: 蘑菇科普|1319 次阅读|没有评论
分享 吃蘑菇的小蜗牛
2019-6-10 20:07
吃蘑菇的小蜗牛 雨过天未晴,太阳不是很大,空气也还算潮湿,很多蘑菇都在这个时候长出来,趁着还不是太干燥赶紧开伞释放孢子。 蜗牛和其他小动物们当然不想错过这样一场真菌盛宴吖,纷纷出门寻找自己喜爱的小蘑菇~ &n ...
个人分类: 蘑菇科普|1378 次阅读|没有评论
分享 谈谈菌根网络
2019-6-10 20:05
真菌在生态系统中不仅仅是分解者,还能寄生植物、动物和真菌,同时,也为许多动物提供了食物和栖息、育幼场所。这次,我们聊一聊真菌的菌根网络! 我们常常见到的蘑菇只是大型真菌的一个繁殖组织,而它的主体— ...
个人分类: 蘑菇科普|1293 次阅读|没有评论
分享 用R语言计算植物群落的重要值 (IV, Important Value)
2019-6-10 20:02
假期前往了几个自然保护区做植物调查,拿到了不少植物群落的数据。之前都懒得写,最近老板突然让交一篇论文,大家都手忙脚乱的处理数据QWQ!之前学习R语言,还有处理遥感数据的时候都查了不少博客里的攻略,让项目顺利完成,但是这次就没有查到处理植物群落的攻略,想着自己的R语言也写了挺久了,索性自己写一下吧! 关于 ...
个人分类: 数据分析|1023 次阅读|没有评论
分享 麋鹿分布图制作(二)—— 用Python和R在地图上打点
2019-6-10 20:00
上期用Python调用百度API得到地点的经纬度, 今天就将这些点标注在地图上。 首先我们用R语言来标注。 文中用到的文件已上传到 Github 。 library ( rgdal ) library ( ggplot2 ) library ( mapproj ) library ( xlsx ) # 设置一下工作路径 setwd ...
个人分类: 数据分析|731 次阅读|没有评论
分享 麋鹿分布图制作(一)——调用百度API查询地名的坐标
2019-6-10 19:57
最近在做保护生物学的论文,查论文的过程中发现之前的麋鹿分布图是手绘的,看起来真的是。。。,因此我决定重新画一下这个图。 这个地图的绘制我分为两个部分:(一)调用百度API查找地点的经纬度,(二)用python的basemap模块绘制分布图。 我手录了 麋鹿数据(点击下载) 。 在使用百度地图之前,我们需要先注册、申 ...
个人分类: 数据分析|638 次阅读|没有评论
分享 介绍一些真菌常用的网站
2019-6-7 14:32
介绍一些真菌常用的网站 给大家介绍蘑菇的时候,经常会有人问道蘑菇的一些资料要在哪里去查?小黑就只能非常遗憾地告诉大家,大型真菌领域尚未得到有大家一致认可的研究结果,所以没有一个像eFlora这样的检索网站。 如果需要检索的话,就只能在文献中去找相关类群的检索表了。本文主要给大家介绍一下真菌研 ...
个人分类: 蘑菇科普|702 次阅读|没有评论

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GMT+8, 2019-12-8 21:06

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