crilqy的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/crilqy

博文

[棉花学报]棉属D基因组3个野生棉种Betv1基因鉴定及功能分析

已有 433 次阅读 2019-10-29 10:39 |系统分类:论文交流

摘要:

【目的】对棉花D基因组中Betv1基因家族进行分析,比较其在不同抗性棉种间的表达模式差异,为深入研究Bet v 1基因在棉花抗黄萎病中的作用提供理论依据。

【方法】通过生物信息学方法对D基因组中Betv1基因进行鉴定。通过雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii,D5)、三裂棉(G. trilobum,D8)和瑟伯氏棉(G. thurberi,D1)转录组和实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)分析Betv1基因在黄萎病菌处理下的表达模式。利用病毒诱导的基因沉默技术(VIGS)对Betv1基因进行功能鉴定。

【结果】棉花D基因组中包含59个成员,其中57个基因带有内含子,分布于8条染色体上,多数为亲水性蛋白并定位于细胞质。黄萎病菌胁迫条件下3个野生棉种的Betv1基因表达量与其抗病水平一致。将不同表达水平的基因分为3组,其中第3组基因响应黄萎病菌侵染并在抗病棉种瑟伯氏棉中高表达,表明该组基因可能与黄萎病胁迫应答反应有关。从中筛选出高水平表达的Betv1基因,在陆地棉中沉默相应的同源基因,棉株感病加重,揭示该基因在棉花抵御黄萎病菌侵染过程中起正调控作用。

【结论】响应黄萎病菌胁迫的Betv1基因在棉花抗黄萎病复杂的生物过程中至关重要。本研究结果为棉花Betv1家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析棉花Betv1基因的功能奠定基础。


关键词: 野生棉; 黄萎病; Betv1基因; 转录组; 实时荧光定量聚合酶链式反应; 病毒诱导的基因沉默


作者:董琪,Magwanga Richard Odongo,路普,蔡小彦,周忠丽,王省芬,王星星,许艳超,侯宇清,王艳情,王坤波,刘方,马峙英

棉花学报, 2019, 31(5):361-380.

https://doi.org/10.11963/1002-7807.dqmzy.20190723




http://blog.sciencenet.cn/blog-3405953-1203877.html

上一篇:JCR-棉花去甲基化酶家族全基因组鉴定及表达分析
下一篇:[棉花学报]陆地棉TLP基因家族的全基因组鉴定及表达分析

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备14006957 )

GMT+8, 2019-12-11 22:38

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部